配体格式转换为SMILES - RunDrugLigandToSmilesConversion
功能介绍
配体格式转换为SMILES,如果配体文件中存在多个分子,则只取第一个返回。
授权信息
账号具备所有API的调用权限,如果使用账号下的IAM用户调用当前API,该IAM用户需具备调用API所需的权限,具体权限要求请参见权限和授权项。
URI
POST /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/drug-common/ligand/smiles
请求参数
参数 | 是否必选 | 参数类型 | 描述 |
|---|---|---|---|
X-Auth-Token | 是 | String | 参数解释: 用户Token。 Token认证就是在调用API的时候将Token加到请求消息头,从而通过身份认证,获得操作API的权限,获取Token接口响应消息头中X-Subject-Token的值即为Token。 约束限制: 不涉及 取值范围: 长度为[1-32768]个字符。 默认取值: 不涉及 |
参数 | 是否必选 | 参数类型 | 描述 |
|---|---|---|---|
source | 是 | String | 参数解释: 受体数据源。 约束限制: 不涉及 取值范围:
默认取值: 不涉及 |
url | 否 | String | 参数解释: 文件URL。 约束限制: 当数据源source为外部网络数据时为https地址,为用户私有数据中心时为空间路径,为公共数据场景时为obs地址。 取值范围: 文件URL仅支持以.pdb、.mol2、.sdf、.smi、.cif为结尾,长度为[1-2000]个字符。 默认取值: 不涉及 |
format | 否 | String | 参数解释: 文件格式。 约束限制: 仅数据源source为RAW时提供。 取值范围:
默认取值: 不涉及 |
data | 否 | String | 参数解释: 文件原始数据。 约束限制: 仅数据源source为RAW时提供。 取值范围: 长度为[0-10000000]个字符。 默认取值: 不涉及 |
响应参数
状态码:200
参数 | 参数类型 | 描述 |
|---|---|---|
smiles | String | 参数解释: 分子SMILES表达式。 约束限制: 不涉及 取值范围: 长度为[1-512]个字符。 默认取值: 不涉及 |
请求示例
配体格式转换为SMILES,如果配体文件中存在多个分子,则只取第一个返回。
https://{endpoint}/v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/drug-common/ligand/smiles
{
"source" : "RAW",
"url" : "https://files.rcsb.org/download/1TQN.pdb",
"format" : "PDB",
"data" : "MODEL1.xxxxxxx.END"
} 响应示例
状态码:200
配体格式转换为SMILES成功响应。
{
"smiles" : "[H]OC(=O)c1c(C=O)cc(CC(C(=O)N([H])C2CCCCN(Cc3ccc(-c4ccccc4)cc3)C2=O)N([H])C(C)=O)cc1"
} 状态码
状态码 | 描述 |
|---|---|
200 | 配体格式转换为SMILES成功响应。 |
错误码
请参见错误码。

