生物医药
提供生物医药领域华为自研和开源的多元化套件,支持用户进行训练、微调、推理等。
资产列表
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        资产类型  | 
      
        资产名称  | 
      
        说明  | 
     
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        生物医药  | 
      
        镜像  | 
      
        GenomeAgent  | 
      
        端到端自动化生物信息流程AI智能体,基于大模型的生物信息知识及代码生成能力,以提示词工程为框架自动编写任务计划和代码。  | 
     
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        ESM-2  | 
      
        ESM-2是基于transformer的蛋白质语言模型,使用注意力机制来学习输入序列中氨基酸对之间的相互作用。  | 
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        ProteinMPNN  | 
      
        ProteinMPNN是一种基于深度学习的蛋白质序列设计方法,给定一个蛋白质的backbone结构,预测能折叠成该结构的氨基酸序列。该模型广泛应用于蛋白质设计领域。  | 
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        ColabDesign  | 
      
        ColabDesign是蛋白质设计模型,通过输入蛋白质骨架坐标的pdb文件,基于蛋白质结构预测模型来预测整个蛋白质序列。  | 
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        UFold  | 
      
        UFold是一种基于深度学习的RNA二级结构预测方法,基于一种全新的类图像RNA序列表示方法,通过全卷积网络(Fully Convolutional Networks, FCNs)高效地进行RNA二级结构预测。  | 
     
使用说明
下面以 ProteinMPNN 资产为例,阐述如何使用资产镜像创建Notebook。
- 进入“资产市场 > Notebooks”,单击资产卡片下方“订阅”按钮,即可订阅该资产到空间进行使用。
    
单击资产卡片,可跳转至资产详情页,查看资产详细描述以及使用说明。
图1 资产订阅
    图2 资产详情页
     - 进入空间,在“我的空间 > 镜像”页面列表中,可以查看已订阅的镜像资产。
    图3 已订阅镜像
     - 进入“我的空间 > Notebooks”页面,单击“创建Notebooks”,镜像类型选择“自定义”,选择资产市场已订阅的ProteinMPNN镜像,并设置合适的计算资源数量以及存储挂载路径。
    图4 创建Notebook
    图5 选择自定义镜像
    图6 设置计算资源
     - 打开创建成功的Notebook,参考资产详情页的使用说明进行使用即可。