基因容器 GCS
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复杂依赖任务（DAG）
如果有四个任务，a/b/c/d 我们希望首先执行 任务 a，然后执行 b/c，b/c 同时完成后，最后执行 d，如下图所示：
为了实现这个目标，需要引入 depends 字段。以任务 d为例，完成任务 d 需要首先完成任务 b/c，则depends 字段为：
depends:
- target: b
type: whole
- target: c
type: whole完整代码如下：
version: genecontainer_0_1
inputs:
memory:
default: 1g
type: string
cpu:
default: 0.5c
type: string
tool:
default: bwa:0.7.12
type: string
shell:
default: sh
type: string
workflow:
a:
tool: bwa:0.7.12
type: GCS.Job
resources:
memory: 1g
cpu: 0.5c
commands:
- echo "A"
b:
tool: bwa:0.7.12
type: GCS.Job
resources:
memory: 1g
cpu: 0.5c
commands:
- echo "B"
depends:
- target: a
type: whole
c:
tool: bwa:0.7.12
type: GCS.Job
resources:
memory: 1g
cpu: 0.5c
commands:
- echo "C"
depends:
- target: a
type: whole
d:
tool: bwa:0.7.12
type: GCS.Job
resources:
memory: 1g
cpu: 0.5c
commands:
- echo "D"
depends:
- target: b
type: whole
- target: c
type: whole
volumes:
sample-data:
mount_path: /obs
mount_from:
pvc: ${GCS_DATA_PVC}
temp-data:
mount_path: /sfs
mount_from:
pvc: ${GCS_SFS_PVC}
ref-data:
mount_path: /ref
mount_from:
pvc: ${GCS_REF_PVC}
父主题： 流程语法示例
