inputs
可选项,用于定义测序流程的可变部分。inputs由多个变量组成,最多可定义60个变量,且每个变量名唯一,若变量名重复,则后面定义的将会覆盖之前定义的。
变量可以在流程文件的其他参数中引用,引用方式采用shell脚本方式,即:${var},其中var为变量名称。
inputs格式
inputs:
  <输入参数名称>:
    type: <类型>
    default: <默认值>
    description: <描述,支持中文>
    label: <标签>
 | 
       属性  | 
     
       是否必选  | 
     
       参数类型  | 
     
       参数描述  | 
    
|---|---|---|---|
| 
       输入参数名称  | 
     
       是  | 
     
       String  | 
     
       输入参数名称,由字母、数字和中划线“-”或下划线“_”组成,长度为[1, 20]。  | 
    
| 
       type  | 
     
       是  | 
     
       String  | 
     
       参数类型,请根据参数类型选择,可选范围如下所示。 
  | 
    
| 
       description  | 
     
       否  | 
     
       String  | 
     
       参数描述信息,支持中文,长度为[0, 255]。  | 
    
| 
       default  | 
     
       否  | 
     
       String  | 
     
       参数默认值,按照type填写对应的值。默认值信息可在执行流程时由外部输入替换;若未填写默认值,外部输入将必须填写这个参数的值。 一个变量可以引用另一个变量的值,如: default: /home/${path_var}
      
        须知: 
        默认值的类型和定义的参数类型必须统一。  | 
    
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       label  | 
     
       否  | 
     
       String  | 
     
       参数的标签,用于参数分组,便于管理,以便其他使用者理解。 长度为[0, 64],支持中文。 取值如下所示。 
 此处定义的标签可在控制台界面执行时进行分类展示,如下图中的“group_info”即为标签。 
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inputs配置样例
inputs:
  sample:
    type: string
    default: /home/zhangsan
  split:
    default: 3
    type: number
    label: gatk #为参数分组
 
  
    