基因容器 GCS
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gcs sub wdl
功能
提交单个WDL流程到Cromwell引擎。
语法
gcs sub wdl FILENAME [flags]
参数说明
|
参数名称 |
是否必选 |
简写 |
描述 |
|---|---|---|---|
|
FILENAME |
是 |
不涉及 |
需要执行的WDL流程文件。配置示例请参见投递Cromwell任务。 |
|
--inputs |
否 |
-i |
流程输入文件。配置示例请参见投递Cromwell任务。 |
|
--options |
否 |
-o |
流程运行时配置文件。配置示例请参见投递Cromwell任务。 |
|
--depends |
否 |
-d |
依赖的子流程文件压缩包或者文件目录。 |
|
--server |
否 |
-s |
指定流程运行的环境名称，若不指定，则使用config中设置默认环境信息。 |
使用示例
提交wdl流程。
gcs sub wdl example.wdl -i example.inputs -s gcs-env-test
回显内容如下。
current environment is gcs-env-test
create wdl succeed
{
"id":
"aa215e0b-c896-4138-865e-6cf7921246b6",
"status": "Submitted",
"message": ""
}
父主题： gcs 命令详情
