查询靶点优化作业详情 - ShowTargetOptJob
功能介绍
查询靶点优化作业详情。
授权信息
账号具备所有API的调用权限,如果使用账号下的IAM用户调用当前API,该IAM用户需具备调用API所需的权限,具体权限要求请参见权限和授权项。
URI
GET /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/drug-jobs/target-optimization/{job_id}
请求参数
参数 | 是否必选 | 参数类型 | 描述 |
|---|---|---|---|
X-Auth-Token | 是 | String | 参数解释: 用户Token。 Token认证就是在调用API的时候将Token加到请求消息头,从而通过身份认证,获得操作API的权限,获取Token接口响应消息头中X-Subject-Token的值即为Token。 约束限制: 不涉及 取值范围: 长度为[1-32768]个字符。 默认取值: 不涉及 |
响应参数
状态码:200
参数 | 参数类型 | 描述 |
|---|---|---|
basic_info | DrugJobDto object | 参数解释: 作业基本信息。 约束限制: 不涉及 取值范围: 不涉及 默认取值: 不涉及 |
receptor | TargetOptReceptor object | 参数解释: 受体文件。 约束限制: 不涉及 取值范围: 不涉及 默认取值: 不涉及 |
ligand | TargetOptLigand object | 参数解释: 配体文件。 约束限制: 不涉及 取值范围: 不涉及 默认取值: 不涉及 |
md_params | MdParam object | 参数解释: MD参数配置。 约束限制: 不涉及 取值范围: 不涉及 默认取值: 不涉及 |
参数 | 参数类型 | 描述 |
|---|---|---|
id | String | 参数解释: 作业ID。 约束限制: 不涉及 取值范围: 不涉及 默认取值: 不涉及 |
name | String | 参数解释: 作业的名称。 约束限制: 长度为[1-63]个字符,允许大小写字母、数字、以及特殊字符中划线(-)。 取值范围: 不涉及 默认取值: 不涉及 |
eihealth_project_id | String | 参数解释: 作业所属空间ID,您可以从获取空间ID中获取。 约束限制: 不涉及 取值范围: 长度为[1-63]个字符,允许大小写字母、数字、以及特殊字符中划线(-)。 默认取值: 不涉及 |
eihealth_project_name | String | 参数解释: 作业所属空间名称。 约束限制: 不涉及 取值范围: 不涉及 默认取值: 不涉及 |
labels | Array of strings | 参数解释: 作业标签。 约束限制: 不涉及 取值范围: 不涉及 默认取值: 不涉及 |
status | String | 参数解释: 作业状态。 约束限制: 不涉及 取值范围:
默认取值: 不涉及 |
type | String | 参数解释: 作业类型。 约束限制: 不涉及 取值范围:
默认取值: 不涉及 |
create_time | String | 参数解释: 作业创建时间。 约束限制: 不涉及 取值范围: 不涉及 默认取值: 不涉及 |
finish_time | String | 参数解释: 作业结束时间。 约束限制: 不涉及 取值范围: 不涉及 默认取值: 不涉及 |
start_time | String | 参数解释: 作业开始时间。 约束限制: 不涉及 取值范围: 不涉及 默认取值: 不涉及 |
failed_message | String | 参数解释: 失败提示,当作业执行失败时会返回。 约束限制: 不涉及 取值范围: 不涉及 默认取值: 不涉及 |
user_name | String | 参数解释: 创建任务的用户名称。 约束限制: 不涉及 取值范围: 不涉及 默认取值: 不涉及 |
output_dir | String | 参数解释: 作业结果输出目录。 约束限制: 不涉及 取值范围: 不涉及 默认取值: 不涉及 |
expect_charge_num | Double | 参数解释: 预估功能调用消耗次数。 约束限制: 不涉及 取值范围: 不涉及 默认取值: 不涉及 |
real_charge_num | Double | 参数解释: 实际功能调用消耗次数。 约束限制: 不涉及 取值范围: 不涉及 默认取值: 不涉及 |
progress | Progress object | 参数解释: 作业进度信息。 约束限制: 不涉及 取值范围: 不涉及 默认取值: 不涉及 |
upstream_job_info | String | 参数解释: 上游作业信息。 约束限制: 不涉及 取值范围: 不涉及 默认取值: 不涉及 |
参数 | 参数类型 | 描述 |
|---|---|---|
overall | Float | 参数解释: 整体进度。 约束限制: 不涉及 取值范围: 不涉及 默认取值: 不涉及 |
estimated_finish_time | Long | 参数解释: 预计结束时间,毫秒。 约束限制: 不涉及 取值范围: 不涉及 默认取值: 不涉及 |
参数 | 参数类型 | 描述 |
|---|---|---|
file | ReceptorDrugFile object | 受体文件。 |
balanced_charge | Boolean | 参数解释: 是否平衡电荷。 约束限制: 不涉及 取值范围:
默认取值: true |
water_model | String | 参数解释: 水模型。 约束限制: 不涉及 取值范围:
默认取值: tip3p |
force_field | String | 参数解释: 蛋白立场。 约束限制: 不涉及 取值范围:
默认取值: amber99sb |
ion_type | String | 参数解释: 离子种类。 约束限制: 如果设置了平衡电荷不支持选择None。 取值范围:
默认取值: NaCl |
ion_concentration | Float | 参数解释: 离子浓度,单位 mol/L。 约束限制: 如果离子种类设置为None,离子浓度不支持设置。 取值范围: 0-5.0 默认取值: 0.15 |
参数 | 参数类型 | 描述 |
|---|---|---|
source | String | 参数解释: 受体的数据源。 约束限制: 不涉及 取值范围:
默认取值: 不涉及 |
url | String | 参数解释: 文件URL。 约束限制: 当数据源source为外部网络数据时为https地址,为用户私有数据中心时为空间路径,为公共数据场景时为obs地址。 取值范围: 文件URL仅支持以.pdb格式结尾,长度为[1-2000]个字符。 默认取值: 不涉及 |
format | String | 参数解释: 文件格式。 约束限制: 仅数据源source为RAW时提供。 取值范围:
默认取值: 不涉及 |
data | String | 参数解释: 文件原始数据。 约束限制: 仅数据源source为RAW时提供。 取值范围: 长度为[0-10000000]个字符 默认取值: 不涉及 |
参数 | 参数类型 | 描述 |
|---|---|---|
file | ProbeDrugFile object | 配体文件。 |
force_field | String | 参数解释: 配体力场,支持选择gaff、gaff2。 约束限制: 取值范围:
默认取值: gaff |
参数 | 参数类型 | 描述 |
|---|---|---|
source | String | 参数解释: 受体的数据源。 约束限制: 不涉及 取值范围:
默认取值: 不涉及 |
url | String | 参数解释: 文件URL。 约束限制: 当数据源source为外部网络数据时为https地址,为用户私有数据中心时为空间路径,为公共数据场景时为obs地址。 取值范围: 文件URL仅支持以.pdb、.mol2、.sdf为结尾,长度为[1-2000]个字符。 默认取值: 不涉及 |
format | String | 参数解释: 文件格式。 约束限制: 仅数据源source为RAW时提供。 取值范围:
默认取值: 不涉及 |
data | String | 参数解释: 文件原始数据。 约束限制: 仅数据源source为RAW时提供。 取值范围: 长度为[0-10000000]个字符。 默认取值: 不涉及 |
参数 | 参数类型 | 描述 |
|---|---|---|
timestep_size | Float | 参数解释: MD模拟的时间步长,单位fs。 约束限制: 不涉及 取值范围: 0-5.0 默认取值: 2 |
temperature | Float | 参数解释: MD模拟的温度,单位K。 约束限制: 不涉及 取值范围: 0-1000.0 默认取值: 300 |
step_params | MdStepParam object | 参数解释: 计算步骤参数。 约束限制: 不涉及 取值范围: 不涉及 默认取值: 不涉及 |
请求示例
查询靶点优化作业详情。
https://{endpoint}/v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/drug-jobs/target-optimization/{job_id} 响应示例
状态码:200
OK
{
"basic_info" : {
"id" : "baabcb56-5bb6-11eb-8a0d-fa163e3ddba1",
"name" : "demo-job",
"labels" : [ "labelA", "labelB" ],
"status" : "FINISHED",
"type" : "OPTIMIZATION",
"create_time" : "2021-01-30T02:34:36Z",
"finish_time" : "2021-01-30T02:53:26Z",
"failed_message" : "null",
"user_name" : "demo-user-name",
"output_dir" : "job-analysis/job-name",
"expect_charge_num" : 1,
"real_charge_num" : 1
},
"receptor" : {
"file" : {
"source" : "PRIVATE",
"url" : "project:/dir/file"
},
"balanced_charge" : true,
"water_model" : "tip3p",
"force_field" : "amber99sb",
"ion_type" : "NaCl",
"ion_concentration" : 0.15
},
"ligand" : {
"file" : {
"source" : "PRIVATE",
"url" : "project:/dir/file"
},
"force_field" : "gaff"
},
"md_params" : {
"timestep_size" : 2,
"temperature" : 300,
"step_params" : {
"energy_minimization_steps" : 10000,
"nvt" : 200,
"npt" : 500,
"simulation_time" : 50
}
}
} 状态码
状态码 | 描述 |
|---|---|
200 | OK |
错误码
请参见错误码。

