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更新时间:2025-12-23 GMT+08:00
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查询靶点优化作业详情 - ShowTargetOptJob

功能介绍

查询靶点优化作业详情。

授权信息

账号具备所有API的调用权限,如果使用账号下的IAM用户调用当前API,该IAM用户需具备调用API所需的权限,具体权限要求请参见权限和授权项。

URI

GET /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/drug-jobs/target-optimization/{job_id}

表1 路径参数

参数

是否必选

参数类型

描述

project_id

是

String

参数解释:

项目ID,您可以从获取项目ID中获取。

约束限制:

不涉及

取值范围:

仅支持字母、数字、中划线和下划线,长度为[1-128]个字符。

默认取值:

不涉及

eihealth_project_id

是

String

参数解释:

空间ID,您可以从获取空间ID中获取。

约束限制:

不涉及

取值范围:

仅支持字母、数字、中划线和下划线,长度为[1-128]个字符。

默认取值:

不涉及

job_id

是

String

参数解释:

作业ID。

约束限制:

不涉及

取值范围:

长度为[1-128]个字符。

默认取值:

不涉及

请求参数

表2 请求Header参数

参数

是否必选

参数类型

描述

X-Auth-Token

是

String

参数解释:

用户Token。

Token认证就是在调用API的时候将Token加到请求消息头,从而通过身份认证,获得操作API的权限,获取Token接口响应消息头中X-Subject-Token的值即为Token。

约束限制:

不涉及

取值范围:

长度为[1-32768]个字符。

默认取值:

不涉及

响应参数

状态码:200

表3 响应Body参数

参数

参数类型

描述

basic_info

DrugJobDto object

参数解释:

作业基本信息。

约束限制:

不涉及

取值范围:

不涉及

默认取值:

不涉及

receptor

TargetOptReceptor object

参数解释:

受体文件。

约束限制:

不涉及

取值范围:

不涉及

默认取值:

不涉及

ligand

TargetOptLigand object

参数解释:

配体文件。

约束限制:

不涉及

取值范围:

不涉及

默认取值:

不涉及

md_params

MdParam object

参数解释:

MD参数配置。

约束限制:

不涉及

取值范围:

不涉及

默认取值:

不涉及

表4 DrugJobDto

参数

参数类型

描述

id

String

参数解释:

作业ID。

约束限制:

不涉及

取值范围:

不涉及

默认取值:

不涉及

name

String

参数解释:

作业的名称。

约束限制:

长度为[1-63]个字符,允许大小写字母、数字、以及特殊字符中划线(-)。

取值范围:

不涉及

默认取值:

不涉及

eihealth_project_id

String

参数解释:

作业所属空间ID,您可以从获取空间ID中获取。

约束限制:

不涉及

取值范围:

长度为[1-63]个字符,允许大小写字母、数字、以及特殊字符中划线(-)。

默认取值:

不涉及

eihealth_project_name

String

参数解释:

作业所属空间名称。

约束限制:

不涉及

取值范围:

不涉及

默认取值:

不涉及

labels

Array of strings

参数解释:

作业标签。

约束限制:

不涉及

取值范围:

不涉及

默认取值:

不涉及

status

String

参数解释:

作业状态。

约束限制:

不涉及

取值范围:

  • WAITING:等待中

  • RUNNING:运行中

  • FINISHED:完成

  • FAILED:失败

  • CANCELLED:取消

默认取值:

不涉及

type

String

参数解释:

作业类型。

约束限制:

不涉及

取值范围:

  • DOCKING:分子对接

  • OPTIMIZATION:分子优化

  • ADMET:分子属性预测

  • POC_MOL_DESIGN:靶点口袋分子设计

  • SEARCH:分子搜索

  • GENERATION:分子生成

  • CPI:CPI预测

  • FEP:自由能微扰

  • POCKET_DETECTION:靶点口袋发现

  • TARGET_OPT:靶点优化

  • CLUSTERING:聚类分析

默认取值:

不涉及

create_time

String

参数解释:

作业创建时间。

约束限制:

不涉及

取值范围:

不涉及

默认取值:

不涉及

finish_time

String

参数解释:

作业结束时间。

约束限制:

不涉及

取值范围:

不涉及

默认取值:

不涉及

start_time

String

参数解释:

作业开始时间。

约束限制:

不涉及

取值范围:

不涉及

默认取值:

不涉及

failed_message

String

参数解释:

失败提示,当作业执行失败时会返回。

约束限制:

不涉及

取值范围:

不涉及

默认取值:

不涉及

user_name

String

参数解释:

创建任务的用户名称。

约束限制:

不涉及

取值范围:

不涉及

默认取值:

不涉及

output_dir

String

参数解释:

作业结果输出目录。

约束限制:

不涉及

取值范围:

不涉及

默认取值:

不涉及

expect_charge_num

Double

参数解释:

预估功能调用消耗次数。

约束限制:

不涉及

取值范围:

不涉及

默认取值:

不涉及

real_charge_num

Double

参数解释:

实际功能调用消耗次数。

约束限制:

不涉及

取值范围:

不涉及

默认取值:

不涉及

progress

Progress object

参数解释:

作业进度信息。

约束限制:

不涉及

取值范围:

不涉及

默认取值:

不涉及

upstream_job_info

String

参数解释:

上游作业信息。

约束限制:

不涉及

取值范围:

不涉及

默认取值:

不涉及

表5 Progress

参数

参数类型

描述

overall

Float

参数解释:

整体进度。

约束限制:

不涉及

取值范围:

不涉及

默认取值:

不涉及

estimated_finish_time

Long

参数解释:

预计结束时间,毫秒。

约束限制:

不涉及

取值范围:

不涉及

默认取值:

不涉及

表6 TargetOptReceptor

参数

参数类型

描述

file

ReceptorDrugFile object

受体文件。

balanced_charge

Boolean

参数解释:

是否平衡电荷。

约束限制:

不涉及

取值范围:

  • true:平衡电荷。

  • false:不平衡电荷。

默认取值:

true

water_model

String

参数解释:

水模型。

约束限制:

不涉及

取值范围:

  • spc

  • spce

  • tip3p

  • tip4p

  • tip5p

默认取值:

tip3p

force_field

String

参数解释:

蛋白立场。

约束限制:

不涉及

取值范围:

  • amber03

  • amber94

  • amber96

  • amber99

  • amber99sb

  • amber99sb-ildn

  • amberGS

  • charmm27

  • oplsaa

  • gromos43a1

  • gromos43a2

  • gromos45a3

  • gromos53a5

  • gromos53a6

  • gromos54a7

默认取值:

amber99sb

ion_type

String

参数解释:

离子种类。

约束限制:

如果设置了平衡电荷不支持选择None。

取值范围:

  • NaCl:NaCl

  • MgCl2:MgCl2

  • None:无离子

默认取值:

NaCl

ion_concentration

Float

参数解释:

离子浓度,单位 mol/L。

约束限制:

如果离子种类设置为None,离子浓度不支持设置。

取值范围:

0-5.0

默认取值:

0.15

表7 ReceptorDrugFile

参数

参数类型

描述

source

String

参数解释:

受体的数据源。

约束限制:

不涉及

取值范围:

  • EXTRANET:外部网络数据

  • PRIVATE:私有数据

  • PUBLIC:公共数据

  • RAW :源数据

默认取值:

不涉及

url

String

参数解释:

文件URL。

约束限制:

当数据源source为外部网络数据时为https地址,为用户私有数据中心时为空间路径,为公共数据场景时为obs地址。

取值范围:

文件URL仅支持以.pdb格式结尾,长度为[1-2000]个字符。

默认取值:

不涉及

format

String

参数解释:

文件格式。

约束限制:

仅数据源source为RAW时提供。

取值范围:

  • PDB:PDB文件

默认取值:

不涉及

data

String

参数解释:

文件原始数据。

约束限制:

仅数据源source为RAW时提供。

取值范围:

长度为[0-10000000]个字符

默认取值:

不涉及

表8 TargetOptLigand

参数

参数类型

描述

file

ProbeDrugFile object

配体文件。

force_field

String

参数解释:

配体力场,支持选择gaff、gaff2。

约束限制:

取值范围:

  • gaff

  • gaff2

默认取值:

gaff

表9 ProbeDrugFile

参数

参数类型

描述

source

String

参数解释:

受体的数据源。

约束限制:

不涉及

取值范围:

  • EXTRANET:外部网络数据

  • PRIVATE:私有数据

  • PUBLIC:公共数据

  • RAW :源数据

默认取值:

不涉及

url

String

参数解释:

文件URL。

约束限制:

当数据源source为外部网络数据时为https地址,为用户私有数据中心时为空间路径,为公共数据场景时为obs地址。

取值范围:

文件URL仅支持以.pdb、.mol2、.sdf为结尾,长度为[1-2000]个字符。

默认取值:

不涉及

format

String

参数解释:

文件格式。

约束限制:

仅数据源source为RAW时提供。

取值范围:

  • PDB

  • SDF

  • MOL2

默认取值:

不涉及

data

String

参数解释:

文件原始数据。

约束限制:

仅数据源source为RAW时提供。

取值范围:

长度为[0-10000000]个字符。

默认取值:

不涉及

表10 MdParam

参数

参数类型

描述

timestep_size

Float

参数解释:

MD模拟的时间步长,单位fs。

约束限制:

不涉及

取值范围:

0-5.0

默认取值:

2

temperature

Float

参数解释:

MD模拟的温度,单位K。

约束限制:

不涉及

取值范围:

0-1000.0

默认取值:

300

step_params

MdStepParam object

参数解释:

计算步骤参数。

约束限制:

不涉及

取值范围:

不涉及

默认取值:

不涉及

表11 MdStepParam

参数

参数类型

描述

energy_minimization_steps

Integer

参数解释:

能量最小化的步骤。

约束限制:

不涉及

取值范围:

1-50000

默认取值:

10000

nvt

Float

参数解释:

等温等体步骤模拟的时长,单位ps。

约束限制:

不涉及

取值范围:

0-1000.0

默认取值:

200

npt

Float

参数解释:

等压等温步骤模拟的时长,单位ps。

约束限制:

不涉及

取值范围:

0-1000.0

默认取值:

500

simulation_time

Float

参数解释:

平衡步骤模拟的时长,单位ns。

约束限制:

不涉及

取值范围:

0-50.0

默认取值:

50

请求示例

查询靶点优化作业详情。

https://{endpoint}/v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/drug-jobs/target-optimization/{job_id}

响应示例

状态码:200

OK

{
  "basic_info" : {
    "id" : "baabcb56-5bb6-11eb-8a0d-fa163e3ddba1",
    "name" : "demo-job",
    "labels" : [ "labelA", "labelB" ],
    "status" : "FINISHED",
    "type" : "OPTIMIZATION",
    "create_time" : "2021-01-30T02:34:36Z",
    "finish_time" : "2021-01-30T02:53:26Z",
    "failed_message" : "null",
    "user_name" : "demo-user-name",
    "output_dir" : "job-analysis/job-name",
    "expect_charge_num" : 1,
    "real_charge_num" : 1
  },
  "receptor" : {
    "file" : {
      "source" : "PRIVATE",
      "url" : "project:/dir/file"
    },
    "balanced_charge" : true,
    "water_model" : "tip3p",
    "force_field" : "amber99sb",
    "ion_type" : "NaCl",
    "ion_concentration" : 0.15
  },
  "ligand" : {
    "file" : {
      "source" : "PRIVATE",
      "url" : "project:/dir/file"
    },
    "force_field" : "gaff"
  },
  "md_params" : {
    "timestep_size" : 2,
    "temperature" : 300,
    "step_params" : {
      "energy_minimization_steps" : 10000,
      "nvt" : 200,
      "npt" : 500,
      "simulation_time" : 50
    }
  }
}

状态码

状态码

描述

200

OK

错误码

请参见错误码。

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