查询靶点优化作业详情
功能介绍
查询靶点优化作业详情。
URI
GET /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/drug-jobs/target-optimization/{job_id}
|
参数 |
是否必选 |
参数类型 |
描述 |
|---|---|---|---|
|
project_id |
是 |
String |
参数解释: 项目ID,您可以从获取项目ID中获取。 约束限制: 不涉及 取值范围: 仅支持字母、数字、中划线和下划线,长度为[1-128]个字符。 默认取值: 不涉及 |
|
eihealth_project_id |
是 |
String |
参数解释: 空间ID。 约束限制: 不涉及 取值范围: 仅支持字母、数字、中划线和下划线,长度为[1-128]个字符。 默认取值: 不涉及 |
|
job_id |
是 |
String |
参数解释: 作业ID。 约束限制: 不涉及 取值范围: 长度为[1-128]个字符。 默认取值: 不涉及 |
请求参数
|
参数 |
是否必选 |
参数类型 |
描述 |
|---|---|---|---|
|
X-Auth-Token |
是 |
String |
参数解释: 用户Token。 Token认证就是在调用API的时候将Token加到请求消息头,从而通过身份认证,获得操作API的权限,获取Token接口响应消息头中X-Subject-Token的值即为Token。 约束限制: 不涉及 取值范围: 长度为[1-32768]个字符。 默认取值: 不涉及 |
响应参数
状态码:200
|
参数 |
参数类型 |
描述 |
|---|---|---|
|
basic_info |
DrugJobDto object |
参数解释: 作业基本信息。 约束限制: 不涉及 取值范围: 不涉及 默认取值: 不涉及 |
|
receptor |
TargetOptReceptor object |
参数解释: 受体文件。 约束限制: 不涉及 取值范围: 不涉及 默认取值: 不涉及 |
|
ligand |
TargetOptLigand object |
参数解释: 配体文件。 约束限制: 不涉及 取值范围: 不涉及 默认取值: 不涉及 |
|
md_params |
MdParam object |
参数解释: MD参数配置。 约束限制: 不涉及 取值范围: 不涉及 默认取值: 不涉及 |
|
参数 |
参数类型 |
描述 |
|---|---|---|
|
id |
String |
参数解释: 作业ID。 约束限制: 不涉及 取值范围: 不涉及 默认取值: 不涉及 |
|
name |
String |
参数解释: 作业的名称。 约束限制: 长度为[1-63]个字符,允许大小写字母、数字、以及特殊字符中划线(-)。 取值范围: 不涉及 默认取值: 不涉及 |
|
eihealth_project_id |
String |
参数解释: 作业所属空间ID。 约束限制: 不涉及 取值范围: 长度为[1-63]个字符,允许大小写字母、数字、以及特殊字符中划线(-)。 默认取值: 不涉及 |
|
eihealth_project_name |
String |
参数解释: 作业所属空间名称。 约束限制: 不涉及 取值范围: 不涉及 默认取值: 不涉及 |
|
labels |
Array of strings |
参数解释: 作业标签。 约束限制: 不涉及 取值范围: 不涉及 默认取值: 不涉及 |
|
status |
String |
参数解释: 作业状态。 约束限制: 不涉及 取值范围:
默认取值: 不涉及 |
|
type |
String |
参数解释: 作业类型。 约束限制: 不涉及 取值范围:
默认取值: 不涉及 |
|
create_time |
String |
参数解释: 作业创建时间。 约束限制: 不涉及 取值范围: 不涉及 默认取值: 不涉及 |
|
finish_time |
String |
参数解释: 作业结束时间。 约束限制: 不涉及 取值范围: 不涉及 默认取值: 不涉及 |
|
start_time |
String |
参数解释: 作业开始时间。 约束限制: 不涉及 取值范围: 不涉及 默认取值: 不涉及 |
|
failed_message |
String |
参数解释: 失败提示,当作业执行失败时会返回。 约束限制: 不涉及 取值范围: 不涉及 默认取值: 不涉及 |
|
user_name |
String |
参数解释: 创建任务的用户名称。 约束限制: 不涉及 取值范围: 不涉及 默认取值: 不涉及 |
|
output_dir |
String |
参数解释: 作业结果输出目录。 约束限制: 不涉及 取值范围: 不涉及 默认取值: 不涉及 |
|
expect_charge_num |
Double |
参数解释: 预估功能调用消耗次数。 约束限制: 不涉及 取值范围: 不涉及 默认取值: 不涉及 |
|
real_charge_num |
Double |
参数解释: 实际功能调用消耗次数。 约束限制: 不涉及 取值范围: 不涉及 默认取值: 不涉及 |
|
progress |
Progress object |
参数解释: 作业进度信息。 约束限制: 不涉及 取值范围: 不涉及 默认取值: 不涉及 |
|
upstream_job_info |
String |
参数解释: 上游作业信息。 约束限制: 不涉及 取值范围: 不涉及 默认取值: 不涉及 |
|
参数 |
参数类型 |
描述 |
|---|---|---|
|
overall |
Float |
参数解释: 整体进度。 约束限制: 不涉及 取值范围: 不涉及 默认取值: 不涉及 |
|
estimated_finish_time |
Long |
参数解释: 预计结束时间,毫秒。 约束限制: 不涉及 取值范围: 不涉及 默认取值: 不涉及 |
|
参数 |
参数类型 |
描述 |
|---|---|---|
|
file |
ReceptorDrugFile object |
受体文件。 |
|
balanced_charge |
Boolean |
参数解释: 是否平衡电荷。 约束限制: 不涉及 取值范围:
默认取值: true |
|
water_model |
String |
参数解释: 水模型。 约束限制: 不涉及 取值范围:
默认取值: tip3p |
|
force_field |
String |
参数解释: 蛋白立场。 约束限制: 不涉及 取值范围:
默认取值: amber99sb |
|
ion_type |
String |
参数解释: 离子种类。 约束限制: 如果设置了平衡电荷不支持选择None。 取值范围:
默认取值: NaCl |
|
ion_concentration |
Float |
参数解释: 离子浓度,单位 mol/L。 约束限制: 如果离子种类设置为None,离子浓度不支持设置。 取值范围: 0-5.0 默认取值: 0.15 |
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参数 |
参数类型 |
描述 |
|---|---|---|
|
source |
String |
参数解释: 受体的数据源。 约束限制: 不涉及 取值范围:
默认取值: 不涉及 |
|
url |
String |
参数解释: 文件URL。 约束限制: 当数据源source为外部网络数据时为https地址,为用户私有数据中心时为空间路径,为公共数据场景时为obs地址。 取值范围: 文件URL仅支持以.pdb格式结尾,长度为[1-2000]个字符。 默认取值: 不涉及 |
|
format |
String |
参数解释: 文件格式。 约束限制: 仅数据源source为RAW时提供。 取值范围:
默认取值: 不涉及 |
|
data |
String |
参数解释: 文件原始数据。 约束限制: 仅数据源source为RAW时提供。 取值范围: 长度为[0-10000000]个字符 默认取值: 不涉及 |
|
参数 |
参数类型 |
描述 |
|---|---|---|
|
file |
ProbeDrugFile object |
配体文件。 |
|
force_field |
String |
参数解释: 配体力场,支持选择gaff、gaff2。 约束限制: 取值范围:
默认取值: gaff |
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参数 |
参数类型 |
描述 |
|---|---|---|
|
source |
String |
参数解释: 受体的数据源。 约束限制: 不涉及 取值范围:
默认取值: 不涉及 |
|
url |
String |
参数解释: 文件URL。 约束限制: 当数据源source为外部网络数据时为https地址,为用户私有数据中心时为空间路径,为公共数据场景时为obs地址。 取值范围: 文件URL仅支持以.pdb、.mol2、.sdf为结尾,长度为[1-2000]个字符。 默认取值: 不涉及 |
|
format |
String |
参数解释: 文件格式。 约束限制: 仅数据源source为RAW时提供。 取值范围:
默认取值: 不涉及 |
|
data |
String |
参数解释: 文件原始数据。 约束限制: 仅数据源source为RAW时提供。 取值范围: 长度为[0-10000000]个字符。 默认取值: 不涉及 |
|
参数 |
参数类型 |
描述 |
|---|---|---|
|
timestep_size |
Float |
参数解释: MD模拟的时间步长,单位fs。 约束限制: 不涉及 取值范围: 0-5.0 默认取值: 2 |
|
temperature |
Float |
参数解释: MD模拟的温度,单位K。 约束限制: 不涉及 取值范围: 0-1000.0 默认取值: 300 |
|
step_params |
MdStepParam object |
参数解释: 计算步骤参数。 约束限制: 不涉及 取值范围: 不涉及 默认取值: 不涉及 |
|
参数 |
参数类型 |
描述 |
|---|---|---|
|
energy_minimization_steps |
Integer |
参数解释: 能量最小化的步骤。 约束限制: 不涉及 取值范围: 1-50000 默认取值: 10000 |
|
nvt |
Float |
参数解释: 等温等体步骤模拟的时长,单位ps。 约束限制: 不涉及 取值范围: 0-1000.0 默认取值: 200 |
|
npt |
Float |
参数解释: 等压等温步骤模拟的时长,单位ps。 约束限制: 不涉及 取值范围: 0-1000.0 默认取值: 500 |
|
simulation_time |
Float |
参数解释: 平衡步骤模拟的时长,单位ns。 约束限制: 不涉及 取值范围: 0-50.0 默认取值: 50 |
请求示例
查询靶点优化作业详情。
https://{endpoint}/v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/drug-jobs/target-optimization/{job_id}
响应示例
状态码:200
OK
{
"basic_info" : {
"id" : "baabcb56-5bb6-11eb-8a0d-fa163e3ddba1",
"name" : "demo-job",
"labels" : [ "labelA", "labelB" ],
"status" : "FINISHED",
"type" : "OPTIMIZATION",
"create_time" : "2021-01-30T02:34:36Z",
"finish_time" : "2021-01-30T02:53:26Z",
"failed_message" : "null",
"user_name" : "demo-user-name",
"output_dir" : "job-analysis/job-name",
"expect_charge_num" : 1,
"real_charge_num" : 1
},
"receptor" : {
"file" : {
"source" : "PRIVATE",
"url" : "project:/dir/file"
},
"balanced_charge" : true,
"water_model" : "tip3p",
"force_field" : "amber99sb",
"ion_type" : "NaCl",
"ion_concentration" : 0.15
},
"ligand" : {
"file" : {
"source" : "PRIVATE",
"url" : "project:/dir/file"
},
"force_field" : "gaff"
},
"md_params" : {
"timestep_size" : 2,
"temperature" : 300,
"step_params" : {
"energy_minimization_steps" : 10000,
"nvt" : 200,
"npt" : 500,
"simulation_time" : 50
}
}
}
状态码
|
状态码 |
描述 |
|---|---|
|
200 |
OK |
错误码
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