更新时间:2025-12-23 GMT+08:00
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创建靶点优化作业 - CreateTargetOptJob

功能介绍

创建靶点优化作业。

授权信息

账号具备所有API的调用权限,如果使用账号下的IAM用户调用当前API,该IAM用户需具备调用API所需的权限,具体权限要求请参见权限和授权项。

URI

POST /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/drug-jobs/target-optimization

表1 路径参数

参数

是否必选

参数类型

描述

project_id

是

String

参数解释:

项目ID,您可以从获取项目ID中获取。

约束限制:

不涉及

取值范围:

仅支持字母、数字、中划线和下划线,长度为[1-128]个字符。

默认取值:

不涉及

eihealth_project_id

是

String

参数解释:

空间ID,您可以从获取空间ID中获取。

约束限制:

不涉及

取值范围:

仅支持字母、数字、中划线和下划线,长度为[1-128]个字符。

默认取值:

不涉及

请求参数

表2 请求Header参数

参数

是否必选

参数类型

描述

X-Auth-Token

是

String

参数解释:

用户Token。

Token认证就是在调用API的时候将Token加到请求消息头,从而通过身份认证,获得操作API的权限,获取Token接口响应消息头中X-Subject-Token的值即为Token。

约束限制:

不涉及

取值范围:

长度为[1-32768]个字符。

默认取值:

不涉及

表3 请求Body参数

参数

是否必选

参数类型

描述

basic_info

是

CreateDrugJobBasicInfo object

参数解释:

创建药物作业基本信息。

约束限制:

不涉及

取值范围:

不涉及

默认取值:

不涉及

receptor

是

TargetOptReceptor object

参数解释:

受体文件。

约束限制:

不涉及

取值范围:

不涉及

默认取值:

不涉及

ligand

否

TargetOptLigand object

参数解释:

配体文件。

约束限制:

不涉及

取值范围:

不涉及

默认取值:

不涉及

md_params

否

MdParam object

参数解释:

MD参数配置。

约束限制:

不涉及

取值范围:

不涉及

默认取值:

不涉及

表4 CreateDrugJobBasicInfo

参数

是否必选

参数类型

描述

name

是

String

参数解释:

作业名称。

约束限制:

不涉及

取值范围:

长度范围[5-64],允许大小写字母、数字、空格、下划线(_)和中划线(-),只能以数字或字母开头。

默认取值:

不涉及

labels

否

Array of strings

参数解释:

标签。

约束限制:

标签数量范围为[0-5],单个标签长度为[1-32]个字符,支持中文、字母、数字、空格、下划线(_)和中划线(-),且不能以空格开头或结尾。

取值范围:

不涉及

默认取值:

不涉及

upstream_job_info

否

String

参数解释:

上游作业信息。

约束限制:

不涉及

取值范围:

长度为[1-10240]个字符。

默认取值:

不涉及

表5 TargetOptReceptor

参数

是否必选

参数类型

描述

file

是

ReceptorDrugFile object

受体文件。

balanced_charge

否

Boolean

参数解释:

是否平衡电荷。

约束限制:

不涉及

取值范围:

  • true:平衡电荷。

  • false:不平衡电荷。

默认取值:

true

water_model

否

String

参数解释:

水模型。

约束限制:

不涉及

取值范围:

  • spc

  • spce

  • tip3p

  • tip4p

  • tip5p

默认取值:

tip3p

force_field

否

String

参数解释:

蛋白立场。

约束限制:

不涉及

取值范围:

  • amber03

  • amber94

  • amber96

  • amber99

  • amber99sb

  • amber99sb-ildn

  • amberGS

  • charmm27

  • oplsaa

  • gromos43a1

  • gromos43a2

  • gromos45a3

  • gromos53a5

  • gromos53a6

  • gromos54a7

默认取值:

amber99sb

ion_type

否

String

参数解释:

离子种类。

约束限制:

如果设置了平衡电荷不支持选择None。

取值范围:

  • NaCl:NaCl

  • MgCl2:MgCl2

  • None:无离子

默认取值:

NaCl

ion_concentration

否

Float

参数解释:

离子浓度,单位 mol/L。

约束限制:

如果离子种类设置为None,离子浓度不支持设置。

取值范围:

0-5.0

默认取值:

0.15

表6 ReceptorDrugFile

参数

是否必选

参数类型

描述

source

是

String

参数解释:

受体的数据源。

约束限制:

不涉及

取值范围:

  • EXTRANET:外部网络数据

  • PRIVATE:私有数据

  • PUBLIC:公共数据

  • RAW :源数据

默认取值:

不涉及

url

否

String

参数解释:

文件URL。

约束限制:

当数据源source为外部网络数据时为https地址,为用户私有数据中心时为空间路径,为公共数据场景时为obs地址。

取值范围:

文件URL仅支持以.pdb格式结尾,长度为[1-2000]个字符。

默认取值:

不涉及

format

否

String

参数解释:

文件格式。

约束限制:

仅数据源source为RAW时提供。

取值范围:

  • PDB:PDB文件

默认取值:

不涉及

data

否

String

参数解释:

文件原始数据。

约束限制:

仅数据源source为RAW时提供。

取值范围:

长度为[0-10000000]个字符

默认取值:

不涉及

表7 TargetOptLigand

参数

是否必选

参数类型

描述

file

是

ProbeDrugFile object

配体文件。

force_field

否

String

参数解释:

配体力场,支持选择gaff、gaff2。

约束限制:

取值范围:

  • gaff

  • gaff2

默认取值:

gaff

表8 ProbeDrugFile

参数

是否必选

参数类型

描述

source

是

String

参数解释:

受体的数据源。

约束限制:

不涉及

取值范围:

  • EXTRANET:外部网络数据

  • PRIVATE:私有数据

  • PUBLIC:公共数据

  • RAW :源数据

默认取值:

不涉及

url

否

String

参数解释:

文件URL。

约束限制:

当数据源source为外部网络数据时为https地址,为用户私有数据中心时为空间路径,为公共数据场景时为obs地址。

取值范围:

文件URL仅支持以.pdb、.mol2、.sdf为结尾,长度为[1-2000]个字符。

默认取值:

不涉及

format

否

String

参数解释:

文件格式。

约束限制:

仅数据源source为RAW时提供。

取值范围:

  • PDB

  • SDF

  • MOL2

默认取值:

不涉及

data

否

String

参数解释:

文件原始数据。

约束限制:

仅数据源source为RAW时提供。

取值范围:

长度为[0-10000000]个字符。

默认取值:

不涉及

表9 MdParam

参数

是否必选

参数类型

描述

timestep_size

否

Float

参数解释:

MD模拟的时间步长,单位fs。

约束限制:

不涉及

取值范围:

0-5.0

默认取值:

2

temperature

否

Float

参数解释:

MD模拟的温度,单位K。

约束限制:

不涉及

取值范围:

0-1000.0

默认取值:

300

step_params

否

MdStepParam object

参数解释:

计算步骤参数。

约束限制:

不涉及

取值范围:

不涉及

默认取值:

不涉及

表10 MdStepParam

参数

是否必选

参数类型

描述

energy_minimization_steps

否

Integer

参数解释:

能量最小化的步骤。

约束限制:

不涉及

取值范围:

1-50000

默认取值:

10000

nvt

否

Float

参数解释:

等温等体步骤模拟的时长,单位ps。

约束限制:

不涉及

取值范围:

0-1000.0

默认取值:

200

npt

否

Float

参数解释:

等压等温步骤模拟的时长,单位ps。

约束限制:

不涉及

取值范围:

0-1000.0

默认取值:

500

simulation_time

否

Float

参数解释:

平衡步骤模拟的时长,单位ns。

约束限制:

不涉及

取值范围:

0-50.0

默认取值:

50

响应参数

状态码:201

表11 响应Body参数

参数

参数类型

描述

id

String

参数解释:

作业ID。

约束限制:

不涉及

取值范围:

不涉及

默认取值:

不涉及

limit_concurrency

Integer

参数解释:

限制的并发量。

约束限制:

不涉及

取值范围:

不涉及

默认取值:

不涉及

请求示例

创建靶点优化作业,作业名称为demo-job,受体文件为project:/dir/file,配体文件为project:/dir/file,时间步长为2fs,温度为300k,能量最小化步数为10000,nvt为200ps,npt为500ps,平衡步骤模拟时长为50ns。

https://{endpoint}/v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/drug-jobs/target-optimization

{
  "basic_info" : {
    "name" : "demo-job",
    "labels" : [ "labelA" ]
  },
  "receptor" : {
    "file" : {
      "source" : "PRIVATE",
      "url" : "project:/dir/file"
    },
    "balanced_charge" : true,
    "water_model" : "tip3p",
    "force_field" : "amber99sb",
    "ion_type" : "NaCl",
    "ion_concentration" : 0.15
  },
  "ligand" : {
    "file" : {
      "source" : "PRIVATE",
      "url" : "project:/dir/file"
    },
    "force_field" : "gaff"
  },
  "md_params" : {
    "timestep_size" : 2,
    "temperature" : 300,
    "step_params" : {
      "energy_minimization_steps" : 10000,
      "nvt" : 200,
      "npt" : 500,
      "simulation_time" : 50
    }
  }
}

响应示例

状态码:201

CREATED

  • 创建靶点优化作业成功。

    {
      "id" : "baabcb56-5bb6-11eb-8a0d-fa163e3ddba1"
    }
  • 创建靶点优化作业成功,当前运行作业数已达配额限制,此作业会等待。

    {
      "id" : "baabcb56-5bb6-11eb-8a0d-fa163e3ddba1",
      "limit_concurrency" : 50
    }

状态码

状态码

描述

201

CREATED

错误码

请参见错误码。

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