单分子文件格式转换
功能介绍
单分子文件格式转换。
URI
POST /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/drug-common/toolkit/format-converter
|
参数 |
是否必选 |
参数类型 |
描述 |
|---|---|---|---|
|
project_id |
是 |
String |
参数解释： 项目ID，您可以从获取项目ID中获取。 约束限制： 不涉及 取值范围： 仅支持字母、数字、中划线和下划线，长度为[1-128]个字符。 默认取值： 不涉及 |
|
eihealth_project_id |
是 |
String |
参数解释： 空间ID。 约束限制： 不涉及 取值范围： 仅支持字母、数字、中划线和下划线，长度为[1-128]个字符。 默认取值： 不涉及 |
请求参数
|
参数 |
是否必选 |
参数类型 |
描述 |
|---|---|---|---|
|
X-Auth-Token |
是 |
String |
参数解释： 用户Token。 Token认证就是在调用API的时候将Token加到请求消息头，从而通过身份认证，获得操作API的权限，获取Token接口响应消息头中X-Subject-Token的值即为Token。 约束限制： 不涉及 取值范围： 长度为[1-32768]个字符。 默认取值： 不涉及 |
|
参数 |
是否必选 |
参数类型 |
描述 |
|---|---|---|---|
|
file |
是 |
ConvertFile object |
参数解释： 待转换文件。 约束限制： 不涉及 取值范围： 不涉及 默认取值： 不涉及 |
|
in_format |
是 |
String |
参数解释： 待转换文件格式。 约束限制： 不涉及 取值范围：
默认取值： 不涉及 |
|
out_format |
是 |
String |
参数解释： 转换后文件格式。 约束限制： 不涉及 取值范围：
默认取值： 不涉及 |
|
参数 |
是否必选 |
参数类型 |
描述 |
|---|---|---|---|
|
source |
是 |
String |
参数解释： 受体数据源。 约束限制： 不涉及 取值范围：
默认取值： 不涉及 |
|
url |
否 |
String |
参数解释： 文件URL。 约束限制： 当数据源source为外部网络数据时为https地址，为用户私有数据中心时为项目路径，为公共数据场景时为obs地址。 取值范围： 文件URL仅支持以.pdb、.sdf、.mol2、.smi结尾，长度为[1-2000]个字符。 默认取值： 不涉及 |
|
format |
否 |
String |
参数解释： 文件格式。 约束限制： 不涉及 取值范围：
默认取值： 不涉及 |
|
data |
否 |
String |
参数解释： 文件原始数据。 约束限制： 仅数据源source为RAW时提供。 取值范围： 长度为[0-10000000]个字符。 默认取值： 不涉及 |
响应参数
状态码：200
格式转换后文件内容。
无
请求示例
将外部文件https://files.rcsb.org/download/1TQN.pdb转为SDF格式。
https://{endpoint}/v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/drug-common/toolkit/format-converter
{
"file" : {
"source" : "EXTRANET",
"url" : "https://files.rcsb.org/download/1TQN.pdb"
},
"in_format" : "PDB",
"out_format" : "SDF"
}
响应示例
状态码：200
格式转换后文件内容。
REMARK 1 CREATED WITH OPENMM 7.7, 2023-10-31 CRYST1 48.140 48.140 135.230 90.00 90.00 90.00 P 1 1 ATOM 1 N ALA A 1 35.884 42.999 47.573 1.00 0.00 N ATOM 2 H ALA A 1 35.251 42.514 48.472 1.00 0.00 H ATOM 3 H2 ALA A 1 34.961 43.642 47.135 1.00 0.00 H ATOM 4 H3 ALA A 1 36.444 43.875 48.190 1.00 0.00 H ATOM 5 CA ALA A 1 36.605 42.605 46.370 1.00 0.00 C ATOM 6 HA ALA A 1 36.266 43.206 45.396 1.00 0.00 H ATOM 7 C ALA A 1 36.452 41.114 46.099 1.00 0.00 C ATOM 8 O ALA A 1 36.341 40.696 44.945 1.00 0.00 O ... HETATM 32 C4 UNL Z 1 -1.619 0.123 -1.621 +0.00 +0.00 C HETATM 33 C5 UNL Z 1 -0.461 0.209 -0.648 +0.00 -0.00 C HETATM 34 C6 UNL Z 1 0.464 1.262 -0.731 +0.00 +0.00 C HETATM 35 C7 UNL Z 1 1.530 1.346 0.178 +0.00 +0.00 C HETATM 36 C9 UNL Z 1 1.653 0.391 1.191 +0.00 +0.00 C HETATM 37 C10 UNL Z 1 0.748 -0.676 1.263 +0.00 +0.00 C HETATM 38 C11 UNL Z 1 -0.302 -0.765 0.348 +0.00 +0.00 C HETATM 39 C8 UNL Z 1 2.511 2.436 -0.027 +0.00 +0.00 C HETATM 40 O2 UNL Z 1 3.062 3.028 0.891 +0.00 -0.00 O HETATM 41 C12 UNL Z 1 2.682 0.463 2.236 +0.00 +0.00 C HETATM 42 O4 UNL Z 1 3.273 -0.478 2.728 +0.00 -0.01 O HETATM 43 O3 UNL Z 1 2.796 1.722 2.692 +0.00 -0.01 O HETATM 44 H12 UNL Z 1 3.751 1.920 2.595 +0.00 +0.00 H TER ENDMDL
状态码
|
状态码 |
描述 |
|---|---|
|
200 |
格式转换后文件内容。 |
错误码
请参见错误码。
