云容器引擎环境

创建环境

开始基因分析前，请先创建环境。

1. 登录GCS控制台，选择左侧导航栏的“环境管理”，在右侧页面单击“创建环境”。
2. 设置“默认环境”：是/否。若当前没有环境，则将要创建的环境即为默认环境。默认环境有且只有一个。在有多个集群时，执行分析任务时如果不指定投递集群，则将任务投递至该默认集群。
3. 选择“环境类型”：“云容器引擎 CCE”。
4. 选择“关联桶”：OBS存储用于存储分析前后产生的数据，包括原始基因数据、流程执行中间数据及执行结果数据。
   • 如果您已有可用桶，在创建环境中，选择对应的桶即可。关联OBS存储，对应对象存储或并行文件系统，并行文件系统详细说明请参见并行文件系统。
   • 如果没有可用桶或是需要新建桶，请单击“创建桶”，基因容器将为您创建一个桶。此处创建的桶无法选择企业项目，默认创建default企业项目。

5. 设置“计算资源”：选择“已有资源”或“新建资源”。如果您在CCE中已有可用集群，则在创建环境时，选择对应的集群做为基因容器的计算资源即可。
   说明：

   为保证有足够的资源，请给基因环境规划独立的集群。

   如果您在CCE中没有可用的集群，或不想使用已有集群，请选择“新建资源”，并根据需求选择集群参数。环境创建成功后，可对计费模式和集群规格进行变更，具体操作请参见查看环境。

   • 计费模式：“按需计费”或“包年/包月”。
     • 按需计费：根据实际使用的资源按小时计费。
     • 包年/包月：包周期计费。包年/包月集群创建后不能删除，如需停止使用，请到用户中心执行退订操作。
   • 集群名称：新建集群的名称。
   • 集群版本：选择集群对应的版本，对应Kubernetes社区基线版本，建议选择最新版本。
   • 集群管理规模：当前集群支持管理的最大节点规模。若选择50节点，表示当前集群最多可管理50个节点。
   • 高可用：高可用集群包含多台管理节点，单管理节点故障时，集群依然可用。推荐使用高可用集群。
   • 企业项目：

     该参数针对企业用户使用。如需使用该功能，请联系客服申请开通。

     企业项目是一种云资源管理方式，企业项目管理服务提供统一的云资源按项目管理，以及项目内的资源管理、成员管理，默认项目为default。

     请从下拉列表中选择所在的企业项目。更多关于企业项目的信息，请参见《企业管理用户指南》。

   • 虚拟私有云：虚拟私有云是通过逻辑方式进行网络隔离，提供安全、隔离的网络环境。若没有可选VPC，单击“创建虚拟私有云”进行创建，参数配置请参考创建虚拟私有云基本信息及默认子网。
   • 所在子网：通过子网提供与其他网络隔离的、可以独享的网络资源，以提高网络安全。若没有可选子网，单击“创建子网”进行创建。如果集群规模超过250台，那么子网大于255.255.255.0。
   • 可用区：指在同一服务区内，电力和网络互相独立的地理区域。一个区域内有多个可用区，一个可用区发生故障后不会影响同一区域内的其它可用区，可用区之间通过内网访问。
   • 节点规格：选择所需的规格（通用计算增强型/通用型计算型/GPU加速型），选择节点的CPU配额和内存配额。
     • 通用计算增强型：计算增强型实例具有性能稳定且资源独享的特点，满足计算性能高且稳定的企业级工作负载诉求。
     • 通用型计算型：通用计算型实例提供均衡的计算、存储以及网络配置，适用于大多数的使用场景。通用计算型实例可用于Web服务器、开发测试环境以及小型数据库应用等场景。
     • GPU加速型：GPU实例提供图形处理器 (GPU) 及较高的计算性能配置的实例，可以适用于图形渲染要求较高的应用，例如高清视频、图形渲染、远程桌面等场景。
   • 节点个数：单击，选择添加的节点个数。
   • 操作系统：选择节点对应的操作系统。推荐使用EulerOS 2.2。
   • 系统盘：磁盘类型为“普通IO”、“高IO”或“超高IO”，磁盘大小可设置为40~1024GB。
     • 普通IO：由SATA存储提供资源的磁盘类型，该类型云硬盘的最大IOPS为1000；
     • 高IO：由SAS存储提供资源的磁盘类型，该类型云硬盘的最大IOPS为3000；
     • 超高IO：由SSD存储提供资源的磁盘类型，该类型云硬盘的最大IOPS为20000。
   • 数据盘：磁盘类型为“普通IO”、“高IO”或“超高IO”，磁盘大小可设置为100~32678GB。
   • 登录方式：“密钥对”或“密码”。
     • 密钥对：选择登录节点的密钥对。密钥对用于远程登录节点时的身份认证，若没有密钥对，可单击“创建SSH密钥对”来新建。
     • 密码：输入登录节点的密码，并确认密码。

6. 单击“下一步”，确认环境信息配置后单击“提交”。系统将跳转到“环境管理”页面，环境创建预计需要花费6-10分钟时间。新建资源的环境您可单击“查看详情”，前往CCE页面查看集群创建详情。

查看环境

创建环境后，可以通过查看环境确认环境的状态和信息。

1. 登录GCS控制台，选择左侧导航栏的“环境管理”，单击“云容器引擎”页签。在环境列表页可查看环境状态、集群名称、计费模式、关联桶等，如图1。
   图1 CCE环境列表页
   
   在环境列表页您可执行变更关联桶、查看集群详情、查看集群监控、休眠/唤醒环境、清理环境等操作。

   • 变更关联桶：单击关联桶后的，在弹出的对话框中选择其他桶，然后单击“确认”。
   • 查看集群详情：单击集群名称，前往CCE界面查看集群详情。
   • 查看集群监控：单击，进入集群监控页面查看集群节点、控制节点、工作负载和负载实例的CPU、内存和磁盘等的使用情况。
   • 环境休眠/唤醒：单击“环境休眠/唤醒”，可将CCE环境休眠/唤醒，具体操作请参见休眠/唤醒环境。
   • 清理环境：单击“清理环境”，可清理CCE环境，具体操作请参见清理环境。

2. 单击“云容器引擎”的环境名称，进入环境管理详情页面。
   图2 CCE环境管理详情
   

   在环境管理详情页面还可查看节点、控制节点、弹性伸缩、事件、存储等信息。

   • 节点：节点是指接入到平台的计算资源，包括虚拟机、物理机等。您需确保所在项目节点资源充足，若节点资源不足，会导致创建工作负载等操作失败。
     图3 环境管理详情-节点
     

     单击可监控节点的CPU、内存和磁盘的使用情况。

     单击“节点管理”，可根据界面提示使用用户模式对节点进行管理，“按需付费节点”标签为必选，可勾选“禁止自动缩容”、“不再接收新任务”、“任务指定内存”标签。单击“确定”后，在节点页面可查看节点属性，如图3。

     图4 节点管理-用户模式
     

     专业模式的管理方法请参考CCE节点标签管理。

   • 控制节点：控制节点由华为云托管，您不能登录。单击可监控控制节点的CPU、内存和磁盘的使用情况。如果控制节点出现异常，请联系华为云支持定位修复。
   • 弹性伸缩：伸缩策略定义后，可自动触发节点的增减，从而降低人为反复调整资源以应对业务变化和高峰压力的工作量，帮助您节约资源和人力成本。单击“添加策略”，根据界面提示配置集群自动扩缩容参数。
     图5 添加策略
     
     • 密码：自动扩容node节点密码。通过该密码登录node节点执行相关操作，用户名为root。
     • 确认密码：再次输入自动扩容node节点密码。
     • 自动缩容：是否启用集群缩容。
       • 空置时间（min）：启用集群缩容后，集群节点处于unneed状态多长时间后，删除节点（默认10min）。
       • 百分比：启用集群缩容后，集群节点资源低于多少，会进行集群缩容（默认0.5）。
     • 节点总数：可扩容的最大节点总数。
     • cpu总数（核）：可扩容的最大cpu总数（核）。
     • 内存总数（G）：可扩容的最大内存总数（G）。
     • 预置节点池配置：默认资源组，最多可设置10个。集群扩容时，若没有其他可用分组，使用默认分组的资源规格进行扩容节点。
       • 可用区：指同一服务区内，电力和网络互相独立的地理区域。
       • 操作系统：节点对应的操作系统。
       • 节点规格：节点的CPU配置和内存配置。
       • Taints：支持给该节点池扩容出来的节点加Taints来设置反亲和性，每个节点池最多配置10条Taints，每条Taints包含以下3个参数：
         须知：

         Taints是可选项，默认为空。配置时需要配合Pod的toleration使用，否则可能导致扩容失败或者Pod无法调度到扩容节点。

         • Key：必须以字母或数字开头，可以包含字母、数字、连字符、下划线和点，最长63个字符；另外可以使用DNS子域作为前缀，例如example.com/my-app， DNS子域最长253个字符。
         • Value：必须以字符或数字开头，可以包含字母、数字、连字符、下划线和点，最长63个字符。
         • Effect：只可选NoSchedule，PreferNoSchedule或NoExecute。
           须知：

           Effect参数建议选择PreferNoSchedule，这样可使自动扩容的节点能够及时的缩容。

     伸缩策略配置成功后，单击“卸载”可删除策略。

     图6 删除伸缩策略
     
   • 事件：可以在“事件”页签下查看集群的事件。
   • 存储：包括“对象存储卷”、“文件存储卷”和“云硬盘存储卷”，使用方法请参考CCE存储管理。存储卷创建成功后，单击“删除”可删除存储卷。

3. 单击集群名称，您将进入到CCE控制台，可查看集群详情信息。

休眠/唤醒环境

创建环境过程中用到的CCE、ECS、弹性IP等资源创建后即开始收费。当您在某段时间内不使用GCS时，需要休眠CCE环境。而由于CCI环境是按使用量计费，因此环境不使用时不产生费用，不需要休眠。

休眠后环境将保留，按需付费的CCE控制节点将暂停收费，弹性云服务器ECS、绑定的弹性IP等资源仍需收费。处于休眠状态的环境，可以执行唤醒环境操作，环境唤醒后，将继续收取控制环境资源费用。

1. 登录GCS控制台，选择左侧导航栏的“环境管理”。
2. 选择需要休眠的环境，单击“环境休眠”，进入环境休眠详情页面，单击“确认”。
   图7 休眠环境
   

3. 环境休眠后，环境将保留。若需要继续使用环境，可单击“唤醒环境”来执行唤醒环境操作。
   图8 唤醒环境
   

清理环境

为了防止您为不需要的服务付费，建议您使用完成后清理环境。环境清理后基因容器服务将不再使用该集群，集群还将为您保留。已休眠的环境，请先唤醒再删除。如默认环境被清理，则最新创建的环境会自动变成默认环境。

1. 登录GCS控制台，选择左侧导航栏的“环境管理”。
2. 单击“云容器引擎”页签，在需要清理的环境中单击“清理环境”。
   图9 清理环境
   

3. 在弹出的对话框中输入DELETE，环境清理后基因容器服务将不再使用该集群，集群还将为您保留。如需彻底删除该集群，请勾选“删除环境所创建的集群”，然后单击“确认”。
   须知：

   • 只有通过GCS“新建资源”创建的按需计费环境才可以“删除环境所创建的集群”。
   • 包年/包月集群如需停止使用，请到“费用中心”执行退订操作。

查看或删除中间数据

由于中间数据存储在弹性文件服务（以下简称SFS）上，并且系统不会自动检测并清理SFS数据，因此为了确保SFS上有足够的存储空间，请维护中间数据，定期删除数据。