更新时间:2021-03-18 GMT+08:00
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管理Cromwell引擎

创建Cromwell引擎

  1. 登录GCS控制台,选择左侧导航栏的“环境管理”,在右侧页面单击“创建环境”
  2. 设置“默认环境”:是/否。若当前没有环境,则将要创建的环境即为默认环境。默认环境有且只有一个。在有多个集群时,执行测序任务时如果不指定投递环境,则将任务投递至该默认环境。
  3. 选择“环境类型”“Cromwell引擎”
  4. 选择“关联OBS存储”:OBS存储用于存储分析前后产生的数据,包括原始基因数据、流程执行中间数据及执行结果数据。

    • 如果您已有可用桶,在创建环境中,选择对应的桶即可。
    • 如果没有可用桶或是需要新建桶,请单击“创建OBS存储”创建。

    关联OBS存储功能目前正在公测中,如果您还未申请公测,请申请CCI容器实例挂载方式使用OBS文件桶

  5. 选择“命名空间”

    如果您在CCI中没有可用的命名空间,或不想使用已有命名空间,请单击“创建命名空间”,创建命名空间步骤请参见命名空间

  6. 上传“访问密钥”

    单击,在弹出的对话框中上传已下载的访问密钥(AK/SK),单击“确认”。若没有访问密钥,请前往“我的凭证” 的管理访问密钥页面新增并下载访问密钥。

  7. 选择“高速共享存储”

    “高速共享存储”对应的是文件存储服务SFS,用于存储流程中间数据。

    如果没有可用的高速共享存储,或不想使用已有高速共享存储,请单击“创建存储”,在弹出的窗口中选择已有的文件存储,单击“导入”;如果没有文件存储,请单击“创建文件存储”,具体步骤请参见创建SFS文件系统

  8. 配置RDS实例。

    Cromwell引擎需要使用一个数据库存储数据。

    您可以使用已有的RDS实例,也可以选择新建RDS实例,支持的mysql版本为5.6和5.7,新建RDS请填写如图1图2所示参数。

    图1 创建RDS实例
    图2 选择RDS实例规格

  9. 单击“下一步”,填写“环境名称”,确认环境信息配置后单击“提交”。单击“环境管理列表”将跳转“环境管理”页面,环境状态为“运行中”,环境已创建成功。

    图3 Cromwell环境

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