查询自由能微扰作业详情
功能介绍
查询自由能微扰作业详情。
URI
GET /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/drug-jobs/fep/{job_id}
|
参数 |
是否必选 |
参数类型 |
描述 |
|---|---|---|---|
|
project_id |
是 |
String |
参数解释: 项目ID,您可以从获取项目ID中获取。 约束限制: 不涉及 取值范围: 仅支持字母、数字、中划线和下划线,长度为[1-128]个字符。 默认取值: 不涉及 |
|
eihealth_project_id |
是 |
String |
参数解释: 空间ID。 约束限制: 不涉及 取值范围: 仅支持字母、数字、中划线和下划线,长度为[1-128]个字符。 默认取值: 不涉及 |
|
job_id |
是 |
String |
参数解释: 作业ID。 约束限制: 不涉及 取值范围: 长度为[1-128]个字符。 默认取值: 不涉及 |
请求参数
|
参数 |
是否必选 |
参数类型 |
描述 |
|---|---|---|---|
|
X-Auth-Token |
是 |
String |
参数解释: 用户Token。 Token认证就是在调用API的时候将Token加到请求消息头,从而通过身份认证,获得操作API的权限,获取Token接口响应消息头中X-Subject-Token的值即为Token。 约束限制: 不涉及 取值范围: 长度为[1-32768]个字符。 默认取值: 不涉及 |
响应参数
状态码:200
|
参数 |
参数类型 |
描述 |
|---|---|---|
|
basic_info |
DrugJobDto object |
参数解释: 作业基本信息。 约束限制: 不涉及 取值范围: 不涉及 默认取值: 不涉及 |
|
receptor |
ReceptorDrugFile object |
受体文件。 |
|
add_membrane |
Boolean |
参数解释: 是否加膜处理。 约束限制: 不涉及 取值范围:
默认取值: false |
|
ligands |
Array of LigandPreviewDto objects |
参数解释: 配体列表。 约束限制: 不涉及 取值范围: 不涉及 默认取值: 不涉及 |
|
graph |
FepGraphDto object |
参数解释: 路径图。 约束限制: 不涉及 取值范围: 不涉及 默认取值: 不涉及 |
|
params |
FepParamDto object |
参数解释: FEP设置参数。 约束限制: 不涉及 取值范围: 不涉及 默认取值: 不涉及 |
|
job_result |
JobResult object |
参数解释: 作业结果信息。 约束限制: 不涉及 取值范围: 不涉及 默认取值: 不涉及 |
|
part_failed_reason |
Array of FailedReasonRecord objects |
参数解释: 部分失败原因和数量。 约束限制: 不涉及 取值范围: 不涉及 默认取值: 不涉及 |
|
参数 |
参数类型 |
描述 |
|---|---|---|
|
id |
String |
参数解释: 作业ID。 约束限制: 不涉及 取值范围: 不涉及 默认取值: 不涉及 |
|
name |
String |
参数解释: 作业的名称。 约束限制: 长度为[1-63]个字符,允许大小写字母、数字、以及特殊字符中划线(-)。 取值范围: 不涉及 默认取值: 不涉及 |
|
eihealth_project_id |
String |
参数解释: 作业所属空间ID。 约束限制: 不涉及 取值范围: 长度为[1-63]个字符,允许大小写字母、数字、以及特殊字符中划线(-)。 默认取值: 不涉及 |
|
eihealth_project_name |
String |
参数解释: 作业所属空间名称。 约束限制: 不涉及 取值范围: 不涉及 默认取值: 不涉及 |
|
labels |
Array of strings |
参数解释: 作业标签。 约束限制: 不涉及 取值范围: 不涉及 默认取值: 不涉及 |
|
status |
String |
参数解释: 作业状态。 约束限制: 不涉及 取值范围:
默认取值: 不涉及 |
|
type |
String |
参数解释: 作业类型。 约束限制: 不涉及 取值范围:
默认取值: 不涉及 |
|
create_time |
String |
参数解释: 作业创建时间。 约束限制: 不涉及 取值范围: 不涉及 默认取值: 不涉及 |
|
finish_time |
String |
参数解释: 作业结束时间。 约束限制: 不涉及 取值范围: 不涉及 默认取值: 不涉及 |
|
start_time |
String |
参数解释: 作业开始时间。 约束限制: 不涉及 取值范围: 不涉及 默认取值: 不涉及 |
|
failed_message |
String |
参数解释: 失败提示,当作业执行失败时会返回。 约束限制: 不涉及 取值范围: 不涉及 默认取值: 不涉及 |
|
user_name |
String |
参数解释: 创建任务的用户名称。 约束限制: 不涉及 取值范围: 不涉及 默认取值: 不涉及 |
|
output_dir |
String |
参数解释: 作业结果输出目录。 约束限制: 不涉及 取值范围: 不涉及 默认取值: 不涉及 |
|
expect_charge_num |
Double |
参数解释: 预估功能调用消耗次数。 约束限制: 不涉及 取值范围: 不涉及 默认取值: 不涉及 |
|
real_charge_num |
Double |
参数解释: 实际功能调用消耗次数。 约束限制: 不涉及 取值范围: 不涉及 默认取值: 不涉及 |
|
progress |
Progress object |
参数解释: 作业进度信息。 约束限制: 不涉及 取值范围: 不涉及 默认取值: 不涉及 |
|
upstream_job_info |
String |
参数解释: 上游作业信息。 约束限制: 不涉及 取值范围: 不涉及 默认取值: 不涉及 |
|
参数 |
参数类型 |
描述 |
|---|---|---|
|
overall |
Float |
参数解释: 整体进度。 约束限制: 不涉及 取值范围: 不涉及 默认取值: 不涉及 |
|
estimated_finish_time |
Long |
参数解释: 预计结束时间,毫秒。 约束限制: 不涉及 取值范围: 不涉及 默认取值: 不涉及 |
|
参数 |
参数类型 |
描述 |
|---|---|---|
|
source |
String |
参数解释: 受体的数据源。 约束限制: 不涉及 取值范围:
默认取值: 不涉及 |
|
url |
String |
参数解释: 文件URL。 约束限制: 当数据源source为外部网络数据时为https地址,为用户私有数据中心时为空间路径,为公共数据场景时为obs地址。 取值范围: 文件URL仅支持以.pdb格式结尾,长度为[1-2000]个字符。 默认取值: 不涉及 |
|
format |
String |
参数解释: 文件格式。 约束限制: 仅数据源source为RAW时提供。 取值范围:
默认取值: 不涉及 |
|
data |
String |
参数解释: 文件原始数据。 约束限制: 仅数据源source为RAW时提供。 取值范围: 长度为[0-10000000]个字符 默认取值: 不涉及 |
|
参数 |
参数类型 |
描述 |
|---|---|---|
|
index |
Integer |
参数解释: 配体索引(从0起编号)。 约束限制: 不涉及 取值范围: 0-99 默认取值: 不涉及 |
|
file |
DrugFile object |
参数解释: 配体文件。 约束限制: 不涉及 取值范围: 不涉及 默认取值: 不涉及 |
|
name |
String |
参数解释: 配体名称,如果无名称则自动命名,格式为UNK+索引(从1起编号)。 约束限制: 不涉及 取值范围: 长度为[1-32]个字符。 默认取值: 不涉及 |
|
smiles |
String |
参数解释: 分子SMILES表达式。 约束限制: 不涉及 取值范围: 长度为[1-512]个字符。 默认取值: 不涉及 |
|
参数 |
参数类型 |
描述 |
|---|---|---|
|
source |
String |
参数解释: 受体的数据源。 约束限制: 不涉及 取值范围:
默认取值: 不涉及 |
|
url |
String |
参数解释: 文件URL。 约束限制: 当数据源source为外部网络数据时为https地址,为用户私有数据中心时为空间路径,为公共数据场景时为obs地址。 取值范围: 文件URL仅支持以.pdb、.mol2、.sdf、.smi为结尾,长度为[1-2000]个字符。 默认取值: 不涉及 |
|
format |
String |
参数解释: 文件格式。 约束限制: 仅数据源source为 RAW 时提供。 取值范围:
默认取值: 不涉及 |
|
data |
String |
参数解释: 文件原始数据。 约束限制: 仅数据源source为RAW时提供。 取值范围: 长度为[0-10000000]个字符。 默认取值: 不涉及 |
|
参数 |
参数类型 |
描述 |
|---|---|---|
|
center_id |
String |
参数解释: 中心配体名称。 约束限制: 不涉及 取值范围: 长度为[1-32]个字符。 默认取值: 不涉及 |
|
pairs |
Array of SimilarityDto objects |
参数解释: 配体对列表。 约束限制: 配体长度为[1-100]。 取值范围: 不涉及 默认取值: 不涉及 |
|
参数 |
参数类型 |
描述 |
|---|---|---|
|
ligand_ids |
Array of strings |
参数解释: 配体对。 约束限制: 配体固定数量为2,配体长度为[1-32]个字符。 取值范围: 不涉及 默认取值: 不涉及 |
|
参数 |
参数类型 |
描述 |
|---|---|---|
|
pre_equilibrium_time |
Float |
参数解释: 预平衡时长。 约束限制: 不涉及 取值范围: 范围为(0,200],单位为ps。 默认取值: 100 |
|
equilibrium_time |
Float |
参数解释: 平衡时长。 约束限制: 不涉及 取值范围: 范围为(0,10],单位为ns。 默认取值: 1 |
|
num_pre_equilibrium_steps |
Integer |
参数解释: 预平衡步数。 约束限制: 不涉及 取值范围: 1-200000 默认取值: 50000 |
|
num_equilibrium_steps |
Integer |
参数解释: 平衡步数。 约束限制: 不涉及 取值范围: 1-10000000 默认取值: 500000 |
|
timestep_size |
Float |
参数解释: 时间步长,单位ps。 约束限制: 不涉及 取值范围: 0.001-0.005。 默认取值: 0.002 |
|
num_lambda |
Integer |
参数解释: lambda个数。 约束限制: 不涉及 取值范围: 2-30。 默认取值: 20 |
|
参数 |
参数类型 |
描述 |
|---|---|---|
|
total_count |
Integer |
参数解释: 输入总数。 约束限制: 不涉及 取值范围: 不涉及 默认取值: 不涉及 |
|
failed_count |
Integer |
参数解释: 失败个数。 约束限制: 不涉及 取值范围: 不涉及 默认取值: 不涉及 |
|
sub_tasks_duration |
Array of floats |
参数解释: 子任务运行时长(秒)。 约束限制: 子任务数量范围为[1-30]。 取值范围: 不涉及 默认取值: 不涉及 |
|
num_molecules |
Integer |
参数解释: 分子聚类任务中的分子总数。 约束限制: 不涉及 取值范围: 不涉及 默认取值: 不涉及 |
|
success_count |
Integer |
参数解释: 聚类成功的分子数。 约束限制: 不涉及 取值范围: 不涉及 默认取值: 不涉及 |
请求示例
查询自由能微扰作业详情。
https://{endpoint}/v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/drug-jobs/fep/{job_id}
响应示例
状态码:200
OK
{
"basic_info" : {
"id" : "baabcb56-5bb6-11eb-8a0d-fa163e3ddba1",
"name" : "demo-job",
"labels" : [ "labelA", "labelB" ],
"status" : "FINISHED",
"type" : "OPTIMIZATION",
"create_time" : "2021-01-30T02:34:36Z",
"finish_time" : "2021-01-30T02:53:26Z",
"failed_message" : "null",
"user_name" : "demo-user-name",
"output_dir" : "job-analysis/job-name",
"expect_charge_num" : 1,
"real_charge_num" : 1
},
"receptor" : {
"source" : "PRIVATE",
"url" : "project:/dir/file"
},
"ligands" : [ {
"name" : "GLY:A:514",
"smiles" : "C1CCCCC1",
"index" : 0,
"file" : {
"source" : "RAW",
"format" : "PDB",
"data" : "MODEL1.xxxxxxx.END"
}
}, {
"name" : "UNK1",
"smiles" : "c1ccccc1",
"index" : 0,
"file" : {
"source" : "PRIVATE",
"url" : "project:/dir/file"
}
} ],
"graph" : {
"center_id" : "GLY:A:514",
"pairs" : [ {
"ligand_ids" : [ "GLY:A:514", "DrugBank:UNK1" ]
} ]
},
"params" : {
"num_pre_equilibrium_steps" : 50000,
"num_equilibrium_steps" : 500000,
"timestep_size" : 0.002,
"num_lambda" : 20
},
"job_result" : {
"total_count" : 10,
"failed_count" : 1
}
}
状态码
|
状态码 |
描述 |
|---|---|
|
200 |
OK |
错误码
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