单分子预对接 - CreateMolDockingJob
功能介绍
单分子预对接。
授权信息
账号具备所有API的调用权限,如果使用账号下的IAM用户调用当前API,该IAM用户需具备调用API所需的权限,具体权限要求请参见权限和授权项。
URI
POST /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/drug-common/mol-docking
请求参数
参数 | 是否必选 | 参数类型 | 描述 |
|---|---|---|---|
X-Auth-Token | 是 | String | 参数解释: 用户Token。 Token认证就是在调用API的时候将Token加到请求消息头,从而通过身份认证,获得操作API的权限,获取Token接口响应消息头中X-Subject-Token的值即为Token。 约束限制: 不涉及 取值范围: 长度为[1-32768]个字符。 默认取值: 不涉及 |
参数 | 是否必选 | 参数类型 | 描述 |
|---|---|---|---|
receptor | 是 | ReceptorDto object | 参数解释: 受体文件。 约束限制: 不涉及 取值范围: 不涉及 默认取值: 不涉及 |
ligand | 是 | DrugFile object | 参数解释: 配体文件。 约束限制: 不涉及 取值范围: 不涉及 默认取值: 不涉及 |
engine | 否 | String | 参数解释: 引擎。 约束限制: 不涉及 取值范围:
默认取值: AUTODOCK_VINA |
参数 | 是否必选 | 参数类型 | 描述 |
|---|---|---|---|
name | 否 | String | 参数解释: 靶点名称,仅支持target1、target2。 约束限制: 不涉及 取值范围:
默认取值: 不涉及 |
receptor | 是 | ReceptorDrugFile object | 参数解释: 受体文件。 约束限制: 不涉及 取值范围: 不涉及 默认取值: 不涉及 |
bounding_box | 否 | BoundBoxDto object | 参数解释: 结合口袋,包含口袋中心位置和尺寸大小。 约束限制: 不涉及 取值范围: 不涉及 默认取值: 不涉及 |
remove_ion | 否 | Boolean | 参数解释: 去除受体中的离子。 约束限制: 不涉及 取值范围:
默认取值: true |
remove_water | 否 | Boolean | 参数解释: 去除受体中的水分子。 约束限制: 不涉及 取值范围:
默认取值: true |
remove_ligand | 否 | Boolean | 参数解释: 去除受体中的配体分子。 约束限制: 不涉及 取值范围:
默认取值: true |
add_hydrogen | 否 | Boolean | 参数解释: 增加氢原子。 约束限制: 不涉及 取值范围:
默认取值: false |
参数 | 是否必选 | 参数类型 | 描述 |
|---|---|---|---|
source | 是 | String | 参数解释: 受体数据源。 约束限制: 不涉及 取值范围:
默认取值: 不涉及 |
url | 否 | String | 参数解释: 文件URL。 约束限制: 当数据源source为外部网络数据时为https地址,为用户私有数据中心时为项目路径,为公共数据场景时为obs地址。 取值范围: URL仅支持.pdb结尾,长度为[1-2000]个字符 默认取值: 不涉及 |
format | 否 | String | 参数解释: 文件格式,仅支持PDB。 约束限制: 仅数据源source为RAW时提供。 取值范围:
默认取值: 不涉及 |
data | 否 | String | 参数解释: 文件原始数据。 约束限制: 仅数据源source为RAW时提供。 取值范围: 长度为[0-10000000]个字符。 默认取值: 不涉及 |
参数 | 是否必选 | 参数类型 | 描述 |
|---|---|---|---|
center | 是 | Array of doubles | 参数解释: 口袋中心坐标,x、y、z轴的坐标。 约束限制: 坐标数量固定为3,坐标大小取值为[-9999999-99999999]。 取值范围: 不涉及 默认取值: 不涉及 |
size | 是 | Array of floats | 参数解释: 口袋尺寸大小,x、y、z轴的大小。 约束限制: 数组长度固定为3,数组元素取值范围为[2-500]。 取值范围: 不涉及 默认取值: 不涉及 |
padding | 否 | Float | 参数解释: 填充。 约束限制: 不涉及 取值范围: 0-20 默认取值: 不涉及 |
参数 | 是否必选 | 参数类型 | 描述 |
|---|---|---|---|
source | 是 | String | 参数解释: 受体数据源。 约束限制: 不涉及 取值范围:
默认取值: 不涉及 |
url | 否 | String | 参数解释: 文件URL。 约束限制: 当数据源source为外部网络数据时为https地址,为用户私有数据中心时为空间路径,为公共数据场景时为obs地址 取值范围: 文件仅URL仅支持以.pdb、.mol2、.sdf、.smi为结尾,长度为[1-2000]个字符。 默认取值: 不涉及 |
format | 否 | String | 参数解释: 文件格式。 约束限制: 当数据源source为RAW时提供。 取值范围:
默认取值: 不涉及 |
data | 否 | String | 参数解释: 文件原始数据。 约束限制: 当数据源source为RAW时提供。 取值范围: 长度为[0-10000000]个字符。 默认取值: 不涉及 |
响应参数
状态码:200
参数 | 参数类型 | 描述 |
|---|---|---|
vina_score | Float | 对接打分结果。 参数解释: 对接打分结果。 约束限制: 不涉及 取值范围: 不涉及 默认取值: 不涉及 |
pose | String | 参数解释: 对接构象。 约束限制: 不涉及 取值范围: 不涉及 默认取值: 不涉及 |
请求示例
单分子预对接,受体文件为project:/dir/file,配体文件为project:/dir/file。
https://{endpoint}/v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/drug-common/mol-docking
{
"receptor" : {
"receptor" : {
"source" : "PRIVATE",
"url" : "project:/dir/file"
},
"bounding_box" : {
"center" : [ 0, 0, 0 ],
"size" : [ 10, 10, 10 ]
},
"remove_water" : true,
"remove_ion" : false,
"remove_ligand" : false,
"add_hydrogen" : true
},
"ligand" : {
"source" : "PRIVATE",
"url" : "project:/dir/file"
}
} 响应示例
状态码:200
单分子预对接成功。
{
"vina_score" : -5.05
} 状态码
状态码 | 描述 |
|---|---|
200 | 单分子预对接成功。 |
错误码
请参见错误码。

