更新时间:2025-12-23 GMT+08:00
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单分子预对接 - CreateMolDockingJob

功能介绍

单分子预对接。

授权信息

账号具备所有API的调用权限,如果使用账号下的IAM用户调用当前API,该IAM用户需具备调用API所需的权限,具体权限要求请参见权限和授权项。

URI

POST /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/drug-common/mol-docking

表1 路径参数

参数

是否必选

参数类型

描述

project_id

是

String

参数解释:

项目ID,您可以从获取项目ID中获取。

约束限制:

不涉及

取值范围:

仅支持字母、数字、中划线和下划线,长度为[1-128]个字符。

默认取值:

不涉及

eihealth_project_id

是

String

参数解释:

空间ID,您可以从获取空间ID中获取。

约束限制:

不涉及

取值范围:

仅支持字母、数字、中划线和下划线,长度为[1-128]个字符。

默认取值:

不涉及

请求参数

表2 请求Header参数

参数

是否必选

参数类型

描述

X-Auth-Token

是

String

参数解释:

用户Token。

Token认证就是在调用API的时候将Token加到请求消息头,从而通过身份认证,获得操作API的权限,获取Token接口响应消息头中X-Subject-Token的值即为Token。

约束限制:

不涉及

取值范围:

长度为[1-32768]个字符。

默认取值:

不涉及

表3 请求Body参数

参数

是否必选

参数类型

描述

receptor

是

ReceptorDto object

参数解释:

受体文件。

约束限制:

不涉及

取值范围:

不涉及

默认取值:

不涉及

ligand

是

DrugFile object

参数解释:

配体文件。

约束限制:

不涉及

取值范围:

不涉及

默认取值:

不涉及

engine

否

String

参数解释:

引擎。

约束限制:

不涉及

取值范围:

  • DSDP

  • AUTODOCK_VINA

默认取值:

AUTODOCK_VINA

表4 ReceptorDto

参数

是否必选

参数类型

描述

name

否

String

参数解释:

靶点名称,仅支持target1、target2。

约束限制:

不涉及

取值范围:

  • target1:靶点名称target1。

  • target2:靶点名称target2。

默认取值:

不涉及

receptor

是

ReceptorDrugFile object

参数解释:

受体文件。

约束限制:

不涉及

取值范围:

不涉及

默认取值:

不涉及

bounding_box

否

BoundBoxDto object

参数解释:

结合口袋,包含口袋中心位置和尺寸大小。

约束限制:

不涉及

取值范围:

不涉及

默认取值:

不涉及

remove_ion

否

Boolean

参数解释:

去除受体中的离子。

约束限制:

不涉及

取值范围:

  • true:去除受体中的离子。

  • false:不去除受体中的离子。

默认取值:

true

remove_water

否

Boolean

参数解释:

去除受体中的水分子。

约束限制:

不涉及

取值范围:

  • true:去除受体中水分子。

  • false:不去除受体中水分子。

默认取值:

true

remove_ligand

否

Boolean

参数解释:

去除受体中的配体分子。

约束限制:

不涉及

取值范围:

  • true:去除受体中配体分子。

  • false:不去除受体中配体分子。

默认取值:

true

add_hydrogen

否

Boolean

参数解释:

增加氢原子。

约束限制:

不涉及

取值范围:

  • true:增加氢原子。

  • false:不增加氢原子。

默认取值:

false

表5 ReceptorDrugFile

参数

是否必选

参数类型

描述

source

是

String

参数解释:

受体数据源。

约束限制:

不涉及

取值范围:

  • EXTRANET:外部网络数据

  • PRIVATE:私有数据

  • PUBLIC:公共数据

  • RAW:源数据

默认取值:

不涉及

url

否

String

参数解释:

文件URL。

约束限制:

当数据源source为外部网络数据时为https地址,为用户私有数据中心时为项目路径,为公共数据场景时为obs地址。

取值范围:

URL仅支持.pdb结尾,长度为[1-2000]个字符

默认取值:

不涉及

format

否

String

参数解释:

文件格式,仅支持PDB。

约束限制:

仅数据源source为RAW时提供。

取值范围:

  • PDB

默认取值:

不涉及

data

否

String

参数解释:

文件原始数据。

约束限制:

仅数据源source为RAW时提供。

取值范围:

长度为[0-10000000]个字符。

默认取值:

不涉及

表6 BoundBoxDto

参数

是否必选

参数类型

描述

center

是

Array of doubles

参数解释:

口袋中心坐标,x、y、z轴的坐标。

约束限制:

坐标数量固定为3,坐标大小取值为[-9999999-99999999]。

取值范围:

不涉及

默认取值:

不涉及

size

是

Array of floats

参数解释:

口袋尺寸大小,x、y、z轴的大小。

约束限制:

数组长度固定为3,数组元素取值范围为[2-500]。

取值范围:

不涉及

默认取值:

不涉及

padding

否

Float

参数解释:

填充。

约束限制:

不涉及

取值范围:

0-20

默认取值:

不涉及

表7 DrugFile

参数

是否必选

参数类型

描述

source

是

String

参数解释:

受体数据源。

约束限制:

不涉及

取值范围:

  • EXTRANET:外部网络数据

  • PRIVATE:私有数据

  • PUBLIC:公共数据

  • RAW:源数据

默认取值:

不涉及

url

否

String

参数解释:

文件URL。

约束限制:

当数据源source为外部网络数据时为https地址,为用户私有数据中心时为空间路径,为公共数据场景时为obs地址

取值范围:

文件仅URL仅支持以.pdb、.mol2、.sdf、.smi为结尾,长度为[1-2000]个字符。

默认取值:

不涉及

format

否

String

参数解释:

文件格式。

约束限制:

当数据源source为RAW时提供。

取值范围:

  • PDB:PDB文件

  • SDF:SDF文件

  • MOL2:MOL2文件

  • SMI:SMI文件

默认取值:

不涉及

data

否

String

参数解释:

文件原始数据。

约束限制:

当数据源source为RAW时提供。

取值范围:

长度为[0-10000000]个字符。

默认取值:

不涉及

响应参数

状态码:200

表8 响应Body参数

参数

参数类型

描述

vina_score

Float

对接打分结果。

参数解释:

对接打分结果。

约束限制:

不涉及

取值范围:

不涉及

默认取值:

不涉及

pose

String

参数解释:

对接构象。

约束限制:

不涉及

取值范围:

不涉及

默认取值:

不涉及

请求示例

单分子预对接,受体文件为project:/dir/file,配体文件为project:/dir/file。

https://{endpoint}/v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/drug-common/mol-docking

{
  "receptor" : {
    "receptor" : {
      "source" : "PRIVATE",
      "url" : "project:/dir/file"
    },
    "bounding_box" : {
      "center" : [ 0, 0, 0 ],
      "size" : [ 10, 10, 10 ]
    },
    "remove_water" : true,
    "remove_ion" : false,
    "remove_ligand" : false,
    "add_hydrogen" : true
  },
  "ligand" : {
    "source" : "PRIVATE",
    "url" : "project:/dir/file"
  }
}

响应示例

状态码:200

单分子预对接成功。

{
  "vina_score" : -5.05
}

状态码

状态码

描述

200

单分子预对接成功。

错误码

请参见错误码。

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