更新时间:2025-07-08 GMT+08:00
分享

计算配体间的3D结构差异

功能介绍

计算配体间的3D结构差异。

URI

POST /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/drug-common/ligand/diff3d

表1 路径参数

参数

是否必选

参数类型

描述

project_id

String

参数解释

项目ID,您可以从获取项目ID中获取。

约束限制

不涉及

取值范围

仅支持字母、数字、中划线和下划线,长度为[1-128]个字符。

默认取值

不涉及

eihealth_project_id

String

参数解释

空间ID。

约束限制

不涉及

取值范围

仅支持字母、数字、中划线和下划线,长度为[1-128]个字符。

默认取值

不涉及

请求参数

表2 请求Header参数

参数

是否必选

参数类型

描述

X-Auth-Token

String

参数解释

用户Token。

Token认证就是在调用API的时候将Token加到请求消息头,从而通过身份认证,获得操作API的权限,获取Token接口响应消息头中X-Subject-Token的值即为Token。

约束限制

不涉及

取值范围

长度为[1-32768]个字符。

默认取值

不涉及

表3 请求Body参数

参数

是否必选

参数类型

描述

method

String

参数解释

差异计算方法。

约束限制

不涉及

取值范围

  • RMSD

  • EMD

默认取值

不涉及

file

DrugFile object

参数解释

配体文件。

约束限制

不涉及

取值范围

不涉及

默认取值

不涉及

ref_file

DrugFile object

参数解释

参考的配体文件。

约束限制

不涉及

取值范围

不涉及

默认取值

不涉及

表4 DrugFile

参数

是否必选

参数类型

描述

source

String

参数解释

受体数据源。

约束限制

不涉及

取值范围

  • EXTRANET:外部网络数据

  • PRIVATE:私有数据

  • PUBLIC:公共数据

  • RAW:源数据

默认取值

不涉及

url

String

参数解释

文件URL。

约束限制

当数据源source为外部网络数据时为https地址,为用户私有数据中心时为空间路径,为公共数据场景时为obs地址

取值范围

文件仅URL仅支持以.pdb、.mol2、.sdf、.smi为结尾,长度为[1-2000]个字符。

默认取值

不涉及

format

String

参数解释

文件格式。

约束限制

当数据源source为RAW时提供。

取值范围

  • PDB:PDB文件

  • SDF:SDF文件

  • MOL2:MOL2文件

  • SMI:SMI文件

默认取值

不涉及

data

String

参数解释

文件原始数据。

约束限制

当数据源source为RAW时提供。

取值范围

长度为[0-10000000]个字符。

默认取值

不涉及

响应参数

状态码:200

表5 响应Body参数

参数

参数类型

描述

result

Float

参数解释

差异值。

约束限制

不涉及

取值范围

不涉及

默认取值

不涉及

请求示例

计算配体间的3D结构差异,计算方法为RMSD。

https://{endpoint}/v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/drug-common/ligand/diff3d

{
  "method" : "RMSD",
  "file" : {
    "source" : "PRIVATE",
    "url" : "obs://bucket/path/to/file"
  },
  "ref_file" : {
    "source" : "RAW",
    "format" : "SDF",
    "data" : "xxxxxxx"
  }
}

响应示例

状态码:200

口袋检测成功响应。

{
  "result" : 0.9
}

状态码

状态码

描述

200

口袋检测成功响应。

错误码

请参见错误码

相关文档