计算配体间的3D结构差异
功能介绍
计算配体间的3D结构差异。
URI
POST /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/drug-common/ligand/diff3d
参数 |
是否必选 |
参数类型 |
描述 |
---|---|---|---|
project_id |
是 |
String |
参数解释: 项目ID,您可以从获取项目ID中获取。 约束限制: 不涉及 取值范围: 仅支持字母、数字、中划线和下划线,长度为[1-128]个字符。 默认取值: 不涉及 |
eihealth_project_id |
是 |
String |
参数解释: 空间ID。 约束限制: 不涉及 取值范围: 仅支持字母、数字、中划线和下划线,长度为[1-128]个字符。 默认取值: 不涉及 |
请求参数
参数 |
是否必选 |
参数类型 |
描述 |
---|---|---|---|
X-Auth-Token |
是 |
String |
参数解释: 用户Token。 Token认证就是在调用API的时候将Token加到请求消息头,从而通过身份认证,获得操作API的权限,获取Token接口响应消息头中X-Subject-Token的值即为Token。 约束限制: 不涉及 取值范围: 长度为[1-32768]个字符。 默认取值: 不涉及 |
参数 |
是否必选 |
参数类型 |
描述 |
---|---|---|---|
method |
是 |
String |
参数解释: 差异计算方法。 约束限制: 不涉及 取值范围:
默认取值: 不涉及 |
file |
是 |
DrugFile object |
参数解释: 配体文件。 约束限制: 不涉及 取值范围: 不涉及 默认取值: 不涉及 |
ref_file |
是 |
DrugFile object |
参数解释: 参考的配体文件。 约束限制: 不涉及 取值范围: 不涉及 默认取值: 不涉及 |
参数 |
是否必选 |
参数类型 |
描述 |
---|---|---|---|
source |
是 |
String |
参数解释: 受体数据源。 约束限制: 不涉及 取值范围:
默认取值: 不涉及 |
url |
否 |
String |
参数解释: 文件URL。 约束限制: 当数据源source为外部网络数据时为https地址,为用户私有数据中心时为空间路径,为公共数据场景时为obs地址 取值范围: 文件仅URL仅支持以.pdb、.mol2、.sdf、.smi为结尾,长度为[1-2000]个字符。 默认取值: 不涉及 |
format |
否 |
String |
参数解释: 文件格式。 约束限制: 当数据源source为RAW时提供。 取值范围:
默认取值: 不涉及 |
data |
否 |
String |
参数解释: 文件原始数据。 约束限制: 当数据源source为RAW时提供。 取值范围: 长度为[0-10000000]个字符。 默认取值: 不涉及 |
响应参数
状态码:200
参数 |
参数类型 |
描述 |
---|---|---|
result |
Float |
参数解释: 差异值。 约束限制: 不涉及 取值范围: 不涉及 默认取值: 不涉及 |
请求示例
计算配体间的3D结构差异,计算方法为RMSD。
https://{endpoint}/v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/drug-common/ligand/diff3d { "method" : "RMSD", "file" : { "source" : "PRIVATE", "url" : "obs://bucket/path/to/file" }, "ref_file" : { "source" : "RAW", "format" : "SDF", "data" : "xxxxxxx" } }
响应示例
状态码:200
口袋检测成功响应。
{ "result" : 0.9 }
状态码
状态码 |
描述 |
---|---|
200 |
口袋检测成功响应。 |
错误码
请参见错误码。