
# 基于CCI执行gcs-grammar流程
本文通过创建CCI环境并执行gcs-grammar流程，向您展示GCS的使用流程。
#### 创建环境
在所有操作前，请先完成环境准备，请单击"环境管理 \> 创建环境"，根据界面提示填写参数。
![](https://support.huaweicloud.com/qs-gcs/zh-cn_image_0253531692.png "点击放大")
在"填写环境信息"界面，参数按如下填写，填写完成后，单击"下一步"，在"详情"页确认后，单击"提交"，完成CCI环境的创建。
- 环境类型 基因容器的环境有云容器实例CCI和云容器引擎CCE。本示例使用的是CCI提供的环境。
  
- 默认环境 是否设置为默认环境。如果只有一个环境，默认只能选择"是"。
  
- 关联OBS存储 OBS存储用于存储分析前后产生的数据，包括原始基因数据、流程执行中间数据及执行结果数据。
  选择OBS存储，如果没有OBS桶请单击"创建OBS存储"创建，然后单击![](https://support.huaweicloud.com/qs-gcs/zh-cn_image_0253531693.png)刷新，再选择OBS存储。
  
- 命名空间选择 命名空间是对于同一用户下的云容器实例的逻辑划分，适用于用户中存在多个团队或项目的场景。
  可以选择"已有命名空间"或"新建命名空间"。建议为此环境选择独立命名空间，保证资源的隔离独立，本示例使用新建命名空间。
  选择企业项目，该参数针对企业用户使用。如需使用该功能，请联系客服申请开通。企业项目是一种云资源管理方式，企业项目管理服务提供统一的云资源按项目管理，以及项目内的资源管理、成员管理，默认项目为default。请从下拉列表中选择所在的企业项目。更多关于企业项目的信息，请参见[《企业管理用户指南》](https://support.huaweicloud.com/usermanual-em/zh-cn_topic_0108763975.html)。
  选择命名空间所在的虚拟私有云。虚拟私有云用于构建隔离的、私密的虚拟网络环境，这样在命名空间中容器能够运行于一个隔离的网络环境。如果没有创建虚拟机私有云，请单击"创建虚拟私有云"，完成创建后单击刷新按钮再选择。
  ![](https://support.huaweicloud.com/qs-gcs/zh-cn_image_0253531694.png "点击放大")
  
- 访问密钥 上传访问密钥，用于访问OBS存储桶时鉴权。若您在本地没有访问密钥，请前往[管理访问秘钥](https://console.huaweicloud.com/iam/#/myCredential)新增并下载访问密钥。
  
 
#### 查看环境
待环境创建完成，可以单击环境名称查看环境信息。
![](https://support.huaweicloud.com/qs-gcs/zh-cn_image_0253531695.png "点击放大")
#### 执行测序流程
基因容器提供了gcs-grammar示例流程，通过该流程您可以了解到GCS的编排语法及能力。
该流程的执行顺序以及包含工具，可以通过单击"基因测序 \> 示例流程 \> gcs-grammar"查看流程详细信息。
![](https://support.huaweicloud.com/qs-gcs/zh-cn_image_0253538046.png "点击放大")
执行测序流程请按如下步骤操作。
1. 单击"开始分析"，开始配置流程参数。流程参数中包括"任务信息"、"配置"和"高级设置"。 
   - 任务信息：包括任务名称、环境和存储选择。"高速共享存储"对应的是文件存储服务SFS，用于存储流程中间数据。如果下拉列表中没有选项，请单击"导入存储"在弹窗中选择，如果弹窗中无可选项，请单击创建"文件存储创建"，文件存储需要与CCI命名空间在同一个虚拟私有云。
   
   - 配置：包括"通用配置"和"高级配置"，请根据界面提示信息完成参数配置。
   
   
   
   - 高级设置：可选项，包括"超时时间"、"批次名称"、"优先级"和"订阅消息通知"，使用默认值即可。
   
   
   ![](https://support.huaweicloud.com/qs-gcs/zh-cn_image_0253538404.png "点击放大")
   
   
2. 单击"下一步"，在"执行预览"页面，确认配置信息。
3. 确认无误后，请单击"开始"即可完成流程的创建。
#### 查看分析结果
测序流程执行时间需要数小时，具体时长与环境资源类型、环境资源大小、处理数据大小等相关。使用测试数据，预计要20分钟。
执行过程可以通过"执行结果"页面查看，可查看内容包括"任务进度图"、"流程事件"、"任务事件"、"日志"、"输入"、"输出"和"监控"等。
![](https://support.huaweicloud.com/qs-gcs/zh-cn_image_0253547878.png "点击放大")
gcs-grammar流程在exec-script-flie步骤会执行echo hello world命令，可以在日志中看到该步骤输出的日志。选中"日志"标签，找到exec-script-flie的输出日志文件。![](https://support.huaweicloud.com/qs-gcs/zh-cn_image_0253551206.png "点击放大")
单击"查看"，跳转到应用运维服务中，可以查看到stdout.log输出了hello world。
![](https://support.huaweicloud.com/qs-gcs/zh-cn_image_0253553684.png "点击放大")
#### 清理环境
流程执行完毕后，测序所使用的CCI计算资源会自动释放，无需担心产生多余的费用。
