更新时间:2022-06-22 GMT+08:00

安装和使用社区OpenMPI

操作场景

本节指导用户在BMS上安装和使用社区OpenMPI(以4.0.2版本为例)。

对于集群中的每台BMS,都需要执行该操作。

前提条件

已配置BMS集群间互相免密登录。

操作步骤

  1. 安装OpenMPI。

    1. 下载社区OpenMPI,版本号为“openmpi-4.0.2.tar.bz2”。

      下载地址:https://download.open-mpi.org/release/open-mpi/v4.0/openmpi-4.0.2.tar.bz2

    2. 将下载的OpenMPI压缩包拷贝至BMS内(建议在“/home/rhel”目录下)。
    3. 执行以下命令,解压软件包。

      # tar -xzvf openmpi-4.0.2.tar.bz2

      # cd openmpi-4.0.2

    4. 执行以下命令,安装所需要的依赖包,安装之前请确保BMS能与外网连通。

      # yum install binutils-devel.x86_64 gcc-c++ autoconf automake libtool

      图1 安装binutils-devel.x86_64等依赖包成功

    5. 执行以下命令,安装编译OpenMPI。

      # ./openmpi-4.0.2/configure --prefix=/opt/openmpi-402--enable-mpirun-prefix-by-default --enable-mpi1-compatibility --with-ucx=/opt/ucx160

      # make -j 128 && make install

      图2 OpenMPI安装成功

  1. 配置MPI环境变量。

    1. 普通用户下,在“~/.bashrc”中添加如下环境变量:

      export PATH=$PATH:/opt/openmpi-310/bin

      export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:/opt/openmpi-310/lib

    2. 执行以下命令,导入配置的MPI环境变量。

      $ source ~/.bashrc

    3. 执行以下命令,查看MPI环境变量是否正常。

      $ which mpirun

      图3 环境变量正常

      回显如图3所示表示环境变量正常。

  2. 执行以下命令,在单个BMS上运行社区OpenMPI。

    1. 执行以下命令,生成可执行文件。

      $ cd ~

      $ vi hello.c

      编辑内容如下:

      #include<mpi.h>    
      #include<stdio.h>    
      int main(int argc, char** argv){ 
             //Initialize the MPI environment 
             MPI_Init(NULL, NULL); 
             //Get the number of processes 
             int world_size; 
             MPI_Comm_size(MPI_COMM_WORLD, &world_size); 
             //Get the rank of the process 
             int world_rank; 
             MPI_Comm_rank(MPI_COMM_WORLD, &world_rank); 
             //Get the name of the processor 
             char processor_name[MPI_MAX_PROCESSOR_NAME]; 
             int name_len; 
             MPI_Get_processor_name(processor_name, &name_len); 
             //Print off a hello world message. 
             printf("Hello world from processor %s, rank %d"" out of %d processors\n",processor_name, world_rank, world_size); 
             //Finalize the MPI environment. 
             MPI_Finalize(); 
         }

      $ mpicc hello.c -o hello

      不同版本的MPI运行的hello文件是不同的,都需要使用命令mpicc hello.c -o hello对hello.c文件重新编译。

    2. 执行以下命令,在单个BMS上运行社区OpenMPI。

      $ mpirun -np 2 /home/rhel/hello

      图4 社区OpenMPI运行成功

      回显如图4所示,表示单个BMS上运行社区OpenMPI成功。