Spark基本原理
Spark组件适用于MRS 3.x之前版本。
Spark简介
Spark是一个开源的,并行数据处理框架,能够帮助用户简单的开发快速,统一的大数据应用,对数据进行离线处理,流式处理,交互式分析等等。
Spark提供了一个快速的计算,写入,以及交互式查询的框架。相比于Hadoop,Spark拥有明显的性能优势。Spark使用in-memory的计算方式,通过这种方式来避免一个MapReduce工作流中的多个任务对同一个数据集进行计算时的IO瓶颈。Spark利用Scala语言实现,Scala能够使得处理分布式数据集时,能够像处理本地化数据一样。除了交互式的数据分析,Spark还能够支持交互式的数据挖掘,由于Spark是基于内存的计算,很方便处理迭代计算,而数据挖掘的问题通常都是对同一份数据进行迭代计算。除此之外,Spark能够运行于安装Hadoop 2.0 Yarn的集群。之所以Spark能够在保留MapReduce容错性,数据本地化,可扩展性等特性的同时,能够保证性能的高效,并且避免繁忙的磁盘IO,主要原因是因为Spark创建了一种叫做RDD(Resilient Distributed Dataset)的内存抽象结构。
原有的分布式内存抽象,例如key-value store以及数据库,支持对于可变状态的细粒度更新,这一点要求集群需要对数据或者日志的更新进行备份来保障容错性。这样就会给数据密集型的工作流带来大量的IO开销。而对于RDD来说,它只有一套受限制的接口,仅支持粗粒度的更新,例如map,join等等。通过这种方式,Spark只需要简单的记录建立数据的转换操作的日志,而不是完整的数据集,就能够提供容错性。这种数据的转换链记录就是数据集的溯源。由于并行程序,通常是对一个大数据集应用相同的计算过程,因此之前提到的粗粒度的更新限制并没有想象中的大。事实上,Spark论文中阐述了RDD完全可以作为多种不同计算框架,例如MapReduce,Pregel等的编程模型。并且,Spark同时提供了操作允许用户显式地将数据转换过程持久化到硬盘。对于数据本地化,是通过允许用户能够基于每条记录的键值,控制数据分区实现的。(采用这种方式的一个明显好处是,能够保证两份需要进行关联的数据将会被同样的方式进行哈希)。如果内存的使用超过了物理限制,Spark将会把这些比较大的分区写入到硬盘,由此来保证可扩展性。
Spark具有如下特点:
- 快速:数据处理能力,比MapReduce快10-100倍。
- 易用:可以通过Java,Scala,Python,简单快速的编写并行的应用处理大数据量,Spark提供了超过80种的操作符来帮助用户组件并行程序。
- 普遍性:Spark提供了众多的工具。可以在一个应用中,方便的将这些工具进行组合。
- 与Hadoop集成:Spark能够直接运行于Hadoop的集群,并且能够直接读取现存的Hadoop数据。
MRS服务的Spark组件具有以下优势:
- MRS服务的Spark Streaming组件支持数据实时处理能力而非定时触发。
- MRS服务的Spark组件支持Structured Streaming,支持DataSet API来构建流式应用,提供了exactly-once的语义支持,流和流的join操作支持内连接和外连接。
- MRS服务的Spark组件支持pandas_udf,可以利用pandas_udf替代pyspark中原来的udf对数据进行处理,可以减少60%-90%的处理时长(受具体操作影响)。
- MRS服务的Spark组件支持 Graph 功能,支持图计算作业使用图进行建模。
- MRS服务的SparkSQL兼容部分Hive语法(以Hive-Test-benchmark测试集上的64个SQL语句为准)和标准SQL语法(以tpc-ds测试集上的99个SQL语句为准)。
Spark结构
Spark的结构如图1所示,各模块的说明如表 基本概念说明所示。
模块 |
说明 |
---|---|
Cluster Manager |
集群管理器,管理集群中的资源。Spark支持多种集群管理器,Spark自带的Standalone集群管理器、Mesos或YARN,系统默认采用YARN模式。 |
Application |
Spark应用,由一个Driver Program和多个Executor组成。 |
Deploy Mode |
部署模式,分为cluster和client模式。cluster模式下,Driver会在集群内的节点运行;而在client模式下,Driver在客户端运行(集群外)。 |
Driver Program |
是Spark应用程序的主进程,运行Application的main()函数并创建SparkContext。负责应用程序的解析、生成Stage并调度Task到Executor上。通常SparkContext代表Driver Program。 |
Executor |
在Work Node上启动的进程,用来执行Task,管理并处理应用中使用到的数据。一个Spark应用一般包含多个Executor,每个Executor接收Driver的命令,并执行一到多个Task。 |
Worker Node |
集群中负责启动并管理Executor以及资源的节点。 |
Job |
一个Action算子(比如collect算子)对应一个Job,由并行计算的多个Task组成。 |
Stage |
每个Job由多个Stage组成,每个Stage是一个Task集合,由DAG分割而成。 |
Task |
承载业务逻辑的运算单元,是Spark平台上可执行的最小工作单元。一个应用根据执行计划以及计算量分为多个Task。 |
Spark应用运行原理
Spark的应用运行架构如图 Spark应用运行架构所示,运行流程如下所示:
- 应用程序(Application)是作为一个进程的集合运行在集群上的,由Driver进行协调。
- 在运行一个应用时,Driver会去连接集群管理器(Standalone、Mesos、YARN)申请运行Executor资源,并启动ExecutorBackend。然后由集群管理器在不同的应用之间调度资源。Driver同时会启动应用程序DAG调度、Stage划分、Task生成。
- 然后Spark会把应用的代码(传递给SparkContext的JAR或者Python定义的代码)发送到Executor上。
- 所有的Task执行完成后,用户的应用程序运行结束。
Spark采用Master和Worker的模式,如图 Spark的Master和Worker所示。用户在Spark客户端提交应用程序,调度器将Job分解为多个Task发送到各个Worker中执行,各个Worker将计算的结果上报给Driver(即Master),Driver聚合结果返回给客户端。
在此结构中,有几个说明点:
- 应用之间是独立的。
每个应用有自己的executor进程,Executor启动多个线程,并行地执行任务。无论是在调度方面,或者是executor方面。各个Driver独立调度自己的任务;不同的应用任务运行在不同的JVM上,即不同的Executor。
- 不同Spark应用之间是不共享数据的,除非把数据存储在外部的存储系统上(比如HDFS)。
- 因为Driver程序在集群上调度任务,所以Driver程序最好和worker节点比较近,比如在一个相同的局部网络内。
Spark on YARN有两种部署模式:
- yarn-cluster模式下,Spark的Driver会运行在YARN集群内的ApplicationMaster进程中,ApplicationMaster已经启动之后,提交任务的客户端退出也不会影响任务的运行。
- yarn-client模式下,Driver启动在客户端进程内,ApplicationMaster进程只用来向YARN集群申请资源。
Spark Streaming原理
Spark Streaming是一种构建在Spark上的实时计算框架,扩展了Spark处理大规模流式数据的能力。当前Spark支持两种数据处理方式:
- Direct Streaming
Direct Streaming方式主要通过采用Direct API对数据进行处理。以Kafka Direct接口为例,与启动一个Receiver来连续不断地从Kafka中接收数据并写入到WAL中相比,Direct API简单地给出每个batch区间需要读取的偏移量位置。然后,每个batch的Job被运行,而对应偏移量的数据在Kafka中已准备好。这些偏移量信息也被可靠地存储在checkpoint文件中,应用失败重启时可以直接读取偏移量信息。
图4 Direct Kafka接口数据传输
需要注意的是,Spark Streaming可以在失败后重新从Kafka中读取并处理数据段。然而,由于语义仅被处理一次,重新处理的结果和没有失败处理的结果是一致的。
因此,Direct API消除了需要使用WAL和Receivers的情况,且确保每个Kafka记录仅被接收一次,这种接收更加高效。使得Spark Streaming和Kafka可以很好地整合在一起。总体来说,这些特性使得流处理管道拥有高容错性、高效性及易用性,因此推荐使用Direct Streaming方式处理数据。
- Receiver
在一个Spark Streaming应用开始时(也就是Driver开始时),相关的StreamingContext(所有流功能的基础)使用SparkContext启动Receiver成为长驻运行任务。这些Receiver接收并保存流数据到Spark内存中以供处理。用户传送数据的生命周期如图5所示:
- 接收数据(蓝色箭头)
Receiver将数据流分成一系列小块,存储到Executor内存中。另外,在启用预写日志(Write-ahead Log,简称WAL)以后,数据同时还写入到容错文件系统的预写日志中。
- 通知Driver(绿色箭头)
接收块中的元数据被发送到Driver的StreamingContext。这个元数据包括:
- 定位其在Executor内存中数据位置的块Reference ID。
- 若启用了WAL,还包括块数据在日志中的偏移信息。
- 处理数据(红色箭头)
对每个批次的数据,StreamingContext使用Block信息产生RDD及其Job。StreamingContext通过运行任务处理Executor内存中的Block来执行Job。
- 周期性地设置检查点(橙色箭头)
- 接收数据(蓝色箭头)
容错性
Spark及其RDD允许无缝地处理集群中任何Worker节点的故障。鉴于Spark Streaming建立于Spark之上,因此其Worker节点也具备了同样的容错能力。然而,由于Spark Streaming的长正常运行需求,其应用程序必须也具备从Driver进程(协调各个Worker的主要应用进程)故障中恢复的能力。使Spark Driver能够容错是件很棘手的事情,因为可能是任意计算模式实现的任意用户程序。不过Spark Streaming应用程序在计算上有一个内在的结构:在每批次数据周期性地执行同样的Spark计算。这种结构允许把应用的状态(也叫做Checkpoint)周期性地保存到可靠的存储空间中,并在Driver重新启动时恢复该状态。
对于文件这样的源数据,这个Driver恢复机制足以做到零数据丢失,因为所有的数据都保存在了像HDFS这样的容错文件系统中。但对于像Kafka和Flume等其他数据源,有些接收到的数据还只缓存在内存中,尚未被处理,就有可能会丢失。这是由于Spark应用的分布操作方式引起的。当Driver进程失败时,所有在Cluster Manager中运行的Executor,连同在内存中的所有数据,也同时被终止。为了避免这种数据损失,Spark Streaming引进了WAL功能。
WAL通常被用于数据库和文件系统中,用来保证任何数据操作的持久性,即先将操作记入一个持久的日志,再对数据施加这个操作。若施加操作的过程中执行失败了,则通过读取日志并重新施加前面预定的操作,系统就得到了恢复。下面介绍了如何利用这样的概念保证接收到的数据的持久性。
Kafka数据源使用Receiver来接收数据,是Executor中的长运行任务,负责从数据源接收数据,并且在数据源支持时还负责确认收到数据的结果(收到的数据被保存在Executor的内存中,然后Driver在Executor中运行来处理任务)。
当启用了预写日志以后,所有收到的数据同时还保存到了容错文件系统的日志文件中。此时即使Spark Streaming失败,这些接收到的数据也不会丢失。另外,接收数据的正确性只在数据被预写到日志以后Receiver才会确认,已经缓存但还没有保存的数据可以在Driver重新启动之后由数据源再发送一次。这两个机制确保了零数据丢失,即所有的数据或者从日志中恢复,或者由数据源重发。
如果需要启用预写日志功能,可以通过如下动作实现:
- 通过“streamingContext.checkpoint”设置checkpoint的目录,这个目录是一个HDFS的文件路径,既用作保存流的checkpoint,又用作保存预写日志。
- 设置SparkConf的属性“spark.streaming.receiver.writeAheadLog.enable”为“true”(默认值是“false”)。
在WAL被启用以后,所有Receiver都获得了能够从可靠收到的数据中恢复的优势。建议缓存RDD时不采取多备份选项,因为用于预写日志的容错文件系统很可能也复制了数据。
在启用了预写日志以后,数据接收吞吐率会有降低。由于所有数据都被写入容错文件系统,文件系统的写入吞吐率和用于数据复制的网络带宽,可能就是潜在的瓶颈了。在此情况下,最好创建更多的Recevier增加数据接收的并行度,或使用更好的硬件以增加容错文件系统的吞吐率。
恢复流程
当一个失败的Driver重启时,按如下流程启动:
- 恢复计算(橙色箭头)
- 恢复元数据块(绿色箭头)
- 未完成作业的重新形成(红色箭头)
- 读取保存在日志中的块数据(蓝色箭头)
- 重发尚未确认的数据(紫色箭头)
因此通过预写日志和可靠的Receiver,Spark Streaming就可以保证没有输入数据会由于Driver的失败而丢失。
SparkSQL和DataSet原理
SparkSQL
Spark SQL是Spark中用于结构化数据处理的模块。在Spark应用中,可以无缝的使用SQL语句亦或是DataSet API对结构化数据进行查询。
Spark SQL以及DataSet还提供了一种通用的访问多数据源的方式,可访问的数据源包括Hive、CSV、Parquet、ORC、JSON和JDBC数据源,这些不同的数据源之间也可以实现互相操作。Spark SQL复用了Hive的前端处理逻辑和元数据处理模块,使用Spark SQL可以直接对已有的Hive数据进行查询。
另外,SparkSQL还提供了诸如API、CLI、JDBC等诸多接口,对客户端提供多样接入形式。
Spark SQL Native DDL/DML
Spark 1.5版本将很多DDL/DML命令下压到Hive执行,造成了与Hive的耦合,且在一定程度上不够灵活(比如报错不符合预期、结果与预期不一致等)。
Spark 3.1.1版本实现了命令的本地化,使用Spark SQL Native DDL/DML取代Hive执行DDL/DML命令。一方面实现和Hive的解耦,另一方面可以对命令进行定制化。
DataSet
DataSet是一个由特定域的对象组成的强类型集合,可通过功能或关系操作并行转换其中的对象。 每个Dataset还有一个非类型视图,即由多个列组成的DataSet,称为DataFrame。
DataFrame是一个由多个列组成的结构化的分布式数据集合,等同于关系数据库中的一张表,或者是R/Python中的data frame。DataFrame是Spark SQL中的最基本的概念,可以通过多种方式创建,例如结构化的数据集、Hive表、外部数据库或者是RDD。
可用于DataSet的操作分为Transformation和Action:
- Transformation操作可生成新的DataSet。
- Action操作可触发计算及返回记结果。
通常使用以下两种方法创建一个DataSet:
- 最常见的方法是通过使用SparkSession上的read函数将Spark指向存储系统上的某些文件。
val people = spark.read.parquet("...").as[Person] // Scala DataSet<Person> people = spark.read().parquet("...").as(Encoders.bean(Person.class));//Java
- 还可通过已存在的DataSet上可用的transformation操作来创建数据集。
CLI和JDBCServer
除了API编程接口之外,Spark SQL还对外提供CLI/JDBC接口:
- spark-shell和spark-sql脚本均可以提供CLI,以便于调试。
- JDBCServer提供JDBC接口,外部可直接通过发送JDBC请求来完成结构化数据的计算和解析。
SparkSession原理
SparkSession是Spark编程的统一API,也可看作是读取数据的统一入口。SparkSession提供了一个统一的入口点来执行以前分散在多个类中的许多操作,并且还为那些较旧的类提供了访问器方法,以实现最大的兼容性。
使用构建器模式创建SparkSession。如果存在SparkSession,构建器将自动重用现有的SparkSession;如果不存在则会创建一个SparkSession。 在I/O期间,在构建器中设置的配置项将自动同步到Spark和Hadoop。
import org.apache.spark.sql.SparkSession val sparkSession = SparkSession.builder .master("local") .appName("my-spark-app") .config("spark.some.config.option", "config-value") .getOrCreate()
- SparkSession可以用于对数据执行SQL查询,将结果返回为DataFrame。
sparkSession.sql("select * from person").show
- SparkSession可以用于设置运行时的配置项,这些配置项可以在SQL中使用变量替换。
sparkSession.conf.set("spark.some.config", "abcd") sparkSession.conf.get("spark.some.config") sparkSession.sql("select ${spark.some.config}")
- SparkSession包括一个“catalog”方法,其中包含使用Metastore(即数据目录)的方法。方法返回值为数据集,可以使用相同的Dataset API来运行。
val tables = sparkSession.catalog.listTables() val columns = sparkSession.catalog.listColumns("myTable")
- 底层SparkContext可以通过SparkSession的SparkContext API访问。
val sparkContext = sparkSession.sparkContext
Structured Streaming原理
Structured Streaming是构建在Spark SQL引擎上的流式数据处理引擎,用户可以使用Scala、Java、Python或R中的Dataset/DataFrame API进行流数据聚合运算、按事件时间窗口计算、流流Join等操作。当流数据连续不断的产生时,Spark SQL将会增量的、持续不断的处理这些数据并将结果更新到结果集中。同时,系统通过checkpoint和Write Ahead Logs确保端到端的完全一次性容错保证。
每一条查询的操作都会产生一个结果集Result Table。每一个触发间隔,当新的数据新增到表中,都会最终更新Result Table。无论何时结果集发生了更新,都能将变化的结果写入一个外部的存储系统。
Structured Streaming在OutPut阶段可以定义不同的存储方式,有如下3种:
- Complete Mode:整个更新的结果集都会写入外部存储。整张表的写入操作将由外部存储系统的连接器完成。
- Append Mode:当时间间隔触发时,只有在Result Table中新增加的数据行会被写入外部存储。这种方式只适用于结果集中已经存在的内容不希望发生改变的情况下,如果已经存在的数据会被更新,不适合适用此种方式。
- Update Mode:当时间间隔触发时,只有在Result Table中被更新的数据才会被写入外部存储系统。注意,和Complete Mode方式的不同之处是不更新的结果集不会写入外部存储。
Spark常见基本概念
- RDD
即弹性分布数据集(Resilient Distributed Dataset),是Spark的核心概念。指的是一个只读的,可分区的分布式数据集,这个数据集的全部或部分可以缓存在内存中,在多次计算间重用。
RDD的生成:
- 从HDFS输入创建,或从与Hadoop兼容的其他存储系统中输入创建。
- 从父RDD转换得到新RDD。
- 从数据集合转换而来,通过编码实现。
RDD的存储:
- 用户可以选择不同的存储级别缓存RDD以便重用(RDD有11种存储级别)。
- 当前RDD默认是存储于内存,但当内存不足时,RDD会溢出到磁盘中。
- Dependency(RDD的依赖)
RDD的依赖分别为:窄依赖和宽依赖。
图10 RDD的依赖
- 窄依赖:指父RDD的每一个分区最多被一个子RDD的分区所用。
- 宽依赖:指子RDD的分区依赖于父RDD的所有分区。
窄依赖对优化很有利。逻辑上,每个RDD的算子都是一个fork/join(此join非上文的join算子,而是指同步多个并行任务的barrier):把计算fork到每个分区,算完后join,然后fork/join下一个RDD的算子。如果直接翻译到物理实现,是很不经济的:一是每一个RDD(即使是中间结果)都需要物化到内存或存储中,费时费空间;二是join作为全局的barrier,是很昂贵的,会被最慢的那个节点拖死。如果子RDD的分区到父RDD的分区是窄依赖,就可以实施经典的fusion优化,把两个fork/join合为一个;如果连续的变换算子序列都是窄依赖,就可以把很多个fork/join并为一个,不但减少了大量的全局barrier,而且无需物化很多中间结果RDD,这将极大地提升性能。Spark把这个叫做流水线(pipeline)优化。
- Transformation和Action(RDD的操作)
对RDD的操作包含Transformation(返回值还是一个RDD)和Action(返回值不是一个RDD)两种。RDD的操作流程如图11所示。其中Transformation操作是Lazy的,也就是说从一个RDD转换生成另一个RDD的操作不是马上执行,Spark在遇到Transformations操作时只会记录需要这样的操作,并不会去执行,需要等到有Actions操作的时候才会真正启动计算过程进行计算。Actions操作会返回结果或把RDD数据写到存储系统中。Actions是触发Spark启动计算的动因。
RDD看起来与Scala集合类型没有太大差别,但数据和运行模型大相迥异。
val file = sc.textFile("hdfs://...") val errors = file.filter(_.contains("ERROR")) errors.cache() errors.count()
- textFile算子从HDFS读取日志文件,返回file(作为RDD)。
- filter算子筛出带“ERROR”的行,赋给errors(新RDD)。filter算子是一个Transformation操作。
- cache算子缓存下来以备未来使用。
- count算子返回errors的行数。count算子是一个Action操作。
Transformation操作可以分为如下几种类型:- 视RDD的元素为简单元素。
输入输出一对多,且结果RDD的分区结构不变,如flatMap(map后由一个元素变为一个包含多个元素的序列,然后展平为一个个的元素)。
输入输出一对一,但结果RDD的分区结构发生了变化,如union(两个RDD合为一个,分区数变为两个RDD分区数之和)、coalesce(分区减少)。
从输入中选择部分元素的算子,如filter、distinct(去除重复元素)、subtract(本RDD有、其他RDD无的元素留下来)和sample(采样)。
- 视RDD的元素为Key-Value对。
对单个RDD做一对一运算,如mapValues(保持源RDD的分区方式,这与map不同);
对单个RDD重排,如sort、partitionBy(实现一致性的分区划分,这个对数据本地性优化很重要);
对单个RDD基于key进行重组和reduce,如groupByKey、reduceByKey;
对两个RDD基于key进行join和重组,如join、cogroup。
后三种操作都涉及重排,称为shuffle类操作。
Action操作可以分为如下几种:
- 生成标量,如count(返回RDD中元素的个数)、reduce、fold/aggregate(返回几个标量)、take(返回前几个元素)。
- 生成Scala集合类型,如collect(把RDD中的所有元素倒入Scala集合类型)、lookup(查找对应key的所有值)。
- 写入存储,如与前文textFile对应的saveAsTextFile。
- 还有一个检查点算子checkpoint。当Lineage特别长时(这在图计算中时常发生),出错时重新执行整个序列要很长时间,可以主动调用checkpoint把当前数据写入稳定存储,作为检查点。
- Shuffle
Shuffle是MapReduce框架中的一个特定的phase,介于Map phase和Reduce phase之间,当Map的输出结果要被Reduce使用时,每一条输出结果需要按key哈希,并且分发到对应的Reducer上去,这个过程就是shuffle。由于shuffle涉及到了磁盘的读写和网络的传输,因此shuffle性能的高低直接影响到了整个程序的运行效率。
下图清晰地描述了MapReduce算法的整个流程。
图12 算法流程
概念上shuffle就是一个沟通数据连接的桥梁,实际上shuffle这一部分是如何实现的呢,下面就以Spark为例讲解shuffle在Spark中的实现。
Shuffle操作将一个Spark的Job分成多个Stage,前面的stages会包括一个或多个ShuffleMapTasks,最后一个stage会包括一个或多个ResultTask。
- Spark Application的结构
Spark Application的结构可分为两部分:初始化SparkContext和主体程序。
- Spark shell命令
Spark基本shell命令,支持提交Spark应用。命令为:
./bin/spark-submit \ --class <main-class> \ --master <master-url> \ ... # other options <application-jar> \ [application-arguments]
参数解释:
--class:Spark应用的类名。
--master:Spark用于所连接的master,如yarn-client,yarn-cluster等。
application-jar:Spark应用的jar包的路径。
application-arguments:提交Spark应用的所需要的参数(可以为空)。
- Spark JobHistory Server
用于监控正在运行的或者历史的Spark作业在Spark框架各个阶段的细节以及提供日志显示,帮助用户更细粒度地去开发、配置和调优作业。