# 将传入的蛋白和小分子拼接成复合物结构 #### 功能介绍 将传入的蛋白和小分子拼接成复合物结构。 #### URI POST /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/drug-common/toolkit/complex-combine 表1路径参数 | 参数 | 是否必选 | 参数类型 | 描述 | |:---|:---|:---|:---| | project_id | 是 | String | 项目ID，您可以从[获取项目ID](https://support.huaweicloud.com/api-eihealth/eihealth_33_0044.html)中获取。 最小长度：**1** 最大长度：**128** | | eihealth_project_id | 是 | String | 平台项目ID。 最小长度：**1** 最大长度：**128** | #### 请求参数 表2请求Header参数 | 参数 | 是否必选 | 参数类型 | 描述 | |:---|:---|:---|:---| | X-Auth-Token | 是 | String | 用户Token。Token认证就是在调用API的时候将Token加到请求消息头，从而通过身份认证，获得操作API的权限，[获取Token](https://support.huaweicloud.com/api-eihealth/eihealth_33_0010.html)接口响应消息头中X-Subject-Token的值即为Token。 最小长度：**1** 最大长度：**32768** | 表3请求Body参数 | 参数 | 是否必选 | 参数类型 | 描述 | |:---|:---|:---|:---| | receptor | 是 | [RunReceptorPreprocessReq] object | 受体蛋白文件。 | | ligand | 是 | [ReceptorDrugFileReq] object | 配体小分子文件。 | 表4RunReceptorPreprocessReq | 参数 | 是否必选 | 参数类型 | 描述 | |:---|:---|:---|:---| | file | 是 | [ReceptorDrugFileReq] object | 受体文件。 | | remove_water | 否 | Boolean | 去除水分子。 缺省值：**false** | | remove_ion | 否 | Boolean | 去除离子。 缺省值：**false** | | remove_ligand | 否 | Boolean | 去除配体分子。 缺省值：**false** | | add_hydrogen | 否 | Boolean | 增加氢原子。 缺省值：**false** | 表5ReceptorDrugFileReq | 参数 | 是否必选 | 参数类型 | 描述 | |:---|:---|:---|:---| | source | 是 | String | 受体的数据源：外部网络数据（如RCSB在线数据库）、用户私有数据中心、承载租户公共数据（含样例/公共库）。 枚举值： - **EXTRANET** - **PRIVATE** - **PUBLIC** - **RAW** | | url | 否 | String | 文件URL，当数据源为外部网络数据时为https地址；用户私有数据中心为项目路径、公共数据场景为obs地址。 最小长度：**1** 最大长度：**2000** | | format | 否 | String | 文件格式，仅支持PDB，仅数据源为RAW时提供。 最小长度：**1** 最大长度：**6** | | data | 否 | String | 文件原始数据，仅数据源为RAW时提供。 最小长度：**0** 最大长度：**10000000** | | add_hydrogen | 否 | Boolean | 增加氢原子。 缺省值：**true** | #### 响应参数 无 #### 请求示例 设置受体蛋白文件为1TQN.pdb，配体小分子为1TQN.pdb，拼接成复合物结构。 ``` https://{endpoint}/v1/{project_id}/drug-common/toolkit/surface-points { "receptor" : { "file" : { "source" : "EXTRANET", "url" : "https://files.rcsb.org/download/1TQN.pdb" } }, "ligand" : { "source" : "EXTRANET", "url" : "https://files.rcsb.org/download/1TQN.pdb" } } ``` #### 响应示例 **状态码： 200** 蛋白小分子拼接复合物结果字符串。 ``` REMARK 1 CREATED WITH OPENMM 7.7, 2023-10-31 CRYST1 48.140 48.140 135.230 90.00 90.00 90.00 P 1 1 ATOM 1 N ALA A 1 35.884 42.999 47.573 1.00 0.00 N ATOM 2 H ALA A 1 35.251 42.514 48.472 1.00 0.00 H ATOM 3 H2 ALA A 1 34.961 43.642 47.135 1.00 0.00 H ATOM 4 H3 ALA A 1 36.444 43.875 48.190 1.00 0.00 H ATOM 5 CA ALA A 1 36.605 42.605 46.370 1.00 0.00 C ATOM 6 HA ALA A 1 36.266 43.206 45.396 1.00 0.00 H ATOM 7 C ALA A 1 36.452 41.114 46.099 1.00 0.00 C ATOM 8 O ALA A 1 36.341 40.696 44.945 1.00 0.00 O ... HETATM 32 C4 UNL Z 1 -1.619 0.123 -1.621 +0.00 +0.00 C HETATM 33 C5 UNL Z 1 -0.461 0.209 -0.648 +0.00 -0.00 C HETATM 34 C6 UNL Z 1 0.464 1.262 -0.731 +0.00 +0.00 C HETATM 35 C7 UNL Z 1 1.530 1.346 0.178 +0.00 +0.00 C HETATM 36 C9 UNL Z 1 1.653 0.391 1.191 +0.00 +0.00 C HETATM 37 C10 UNL Z 1 0.748 -0.676 1.263 +0.00 +0.00 C HETATM 38 C11 UNL Z 1 -0.302 -0.765 0.348 +0.00 +0.00 C HETATM 39 C8 UNL Z 1 2.511 2.436 -0.027 +0.00 +0.00 C HETATM 40 O2 UNL Z 1 3.062 3.028 0.891 +0.00 -0.00 O HETATM 41 C12 UNL Z 1 2.682 0.463 2.236 +0.00 +0.00 C HETATM 42 O4 UNL Z 1 3.273 -0.478 2.728 +0.00 -0.01 O HETATM 43 O3 UNL Z 1 2.796 1.722 2.692 +0.00 -0.01 O HETATM 44 H12 UNL Z 1 3.751 1.920 2.595 +0.00 +0.00 H TER ENDMDL ``` #### 状态码 | 状态码 | 描述 | |:---|:---| | 200 | 蛋白小分子拼接复合物结果字符串。 | #### 错误码 请参见[错误码](https://support.huaweicloud.com/api-eihealth/ErrorCode.html)。