# 创建靶点优化作业 #### 功能介绍 创建靶点优化作业。 #### URI POST /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/drug-jobs/target-optimization 表1路径参数 | 参数 | 是否必选 | 参数类型 | 描述 | |:---|:---|:---|:---| | project_id | 是 | String | 项目ID，您可以从[获取项目ID](https://support.huaweicloud.com/api-eihealth/eihealth_33_0044.html)中获取。 最小长度：**1** 最大长度：**128** | | eihealth_project_id | 是 | String | 平台项目ID。 最小长度：**1** 最大长度：**128** | #### 请求参数 表2请求Header参数 | 参数 | 是否必选 | 参数类型 | 描述 | |:---|:---|:---|:---| | X-Auth-Token | 是 | String | 用户Token。Token认证就是在调用API的时候将Token加到请求消息头，从而通过身份认证，获得操作API的权限，获取Token接口响应消息头中X-Subject-Token的值即为Token。 最小长度：**1** 最大长度：**32768** | 表3请求Body参数 | 参数 | 是否必选 | 参数类型 | 描述 | |:---|:---|:---|:---| | basic_info | 是 | [CreateDrugJobBasicInfo] object | 创建药物作业基本信息。 | | receptor | 是 | [TargetOptReceptor] object | 受体文件。 | | ligand | 否 | [TargetOptLigand] object | 配体文件。 | | md_params | 否 | [MdParam] object | MD参数配置。 | 表4CreateDrugJobBasicInfo | 参数 | 是否必选 | 参数类型 | 描述 | |:---|:---|:---|:---| | name | 是 | String | 作业的名称，取值范围：\[5,64\]，允许大小写字母、数字、空格、下划线(_)和中划线(-),只能以数字或字母开头。 最小长度：**5** 最大长度：**64** | | labels | 否 | Array of strings | 标签，取值范围\[0,5\]，单个标签最大长度32字符，支持中文、字母、数字、空格、下划线和中划线，且不能以空格开头或者结尾。 最小长度：**1** 最大长度：**32** 数组长度：**0 - 5** | | upstream_job_info | 否 | String | 上游作业信息。 最小长度：**1** 最大长度：**10240** | 表5TargetOptReceptor | 参数 | 是否必选 | 参数类型 | 描述 | |:---|:---|:---|:---| | file | 是 | [ReceptorDrugFile] object | 受体文件。 | | balanced_charge | 否 | Boolean | 是否平衡电荷。 缺省值：**true** | | water_model | 否 | String | 水模型, 支持选择spc, spce, tip3p, tip4p, tip5p。 缺省值：**tip3p** | | force_field | 否 | String | 蛋白立场，支持选择amber03, amber94, amber96, amber99, amber99sb, amber99sb-ildn, amberGS, charmm27, oplsaa, gromos43a1, gromos43a2, gromos45a3, gromos53a5, gromos53a6, gromos54a7。 缺省值：**amber99sb** | | ion_type | 否 | String | 离子种类，支持选择NaCl、MgCl2、None，若设置了平衡电荷不支持选择None。 缺省值：**NaCl** | | ion_concentration | 否 | Float | 离子浓度，单位mol/L，若离子种类设置为None离子浓度不支持设置。 最小值：**0** 最大值：**5.0** 缺省值：**0.15** | 表6ReceptorDrugFile | 参数 | 是否必选 | 参数类型 | 描述 | |:---|:---|:---|:---| | source | 是 | String | 受体的数据源：外部网络数据（如RCSB在线数据库）、用户私有数据中心、承载租户公共数据（含样例/公共库）。 枚举值： - **EXTRANET** - **PRIVATE** - **PUBLIC** - **RAW** | | url | 否 | String | 文件URL，当数据源为外部网络数据时为https地址；用户私有数据中心为项目路径、公共数据场景为obs地址。 最小长度：**1** 最大长度：**2000** | | format | 否 | String | 文件格式，仅支持PDB，仅数据源为RAW时提供。 最小长度：**1** 最大长度：**6** | | data | 否 | String | 文件原始数据，仅数据源为RAW时提供。 最小长度：**0** 最大长度：**10000000** | 表7TargetOptLigand | 参数 | 是否必选 | 参数类型 | 描述 | |:---|:---|:---|:---| | file | 是 | [ProbeDrugFile] object | 配体文件。 | | force_field | 否 | String | 配体力场, 支持选择gaff, gaff2。 缺省值：**gaff** | 表8ProbeDrugFile | 参数 | 是否必选 | 参数类型 | 描述 | |:---|:---|:---|:---| | source | 是 | String | 受体的数据源：外部网络数据（如RCSB在线数据库）、用户私有数据中心、承载租户公共数据（含样例/公共库）。 枚举值： - **EXTRANET** - **PRIVATE** - **PUBLIC** - **RAW** | | url | 否 | String | 文件URL，当数据源为外部网络数据时为https地址；用户私有数据中心为项目路径、公共数据场景为obs地址。 最小长度：**1** 最大长度：**2000** | | format | 否 | String | 文件格式，支持PDB、SDF、MOL2，仅数据源为RAW时提供。 最小长度：**1** 最大长度：**6** | | data | 否 | String | 文件原始数据，仅数据源为RAW时提供。 最小长度：**0** 最大长度：**10000000** | 表9MdParam | 参数 | 是否必选 | 参数类型 | 描述 | |:---|:---|:---|:---| | timestep_size | 否 | Float | MD模拟的时间步长，单位fs，取值范围：大于0，小于等于5。 最小值：**0** 最大值：**5.0** 缺省值：**2** | | temperature | 否 | Float | MD模拟的温度，单位K。 最小值：**0** 最大值：**1000.0** 缺省值：**300** | | step_params | 否 | [MdStepParam] object | 计算步骤参数。 | 表10MdStepParam | 参数 | 是否必选 | 参数类型 | 描述 | |:---|:---|:---|:---| | energy_minimization_steps | 否 | Integer | 能量最小化的步骤。 最小值：**1** 最大值：**50000** 缺省值：**10000** | | nvt | 否 | Float | 等温等体步骤模拟的时长，单位ps。 最小值：**0** 最大值：**1000.0** 缺省值：**200** | | npt | 否 | Float | 等压等温步骤模拟的时长，单位ps。 最小值：**0** 最大值：**1000.0** 缺省值：**500** | | simulation_time | 否 | Float | 平衡步骤模拟的时长，单位ns。 最小值：**0** 最大值：**50.0** 缺省值：**50** | #### 响应参数 **状态码： 201** 表11响应Body参数 | 参数 | 参数类型 | 描述 | |:---|:---|:---| | id | String | 作业id。 | | limit_concurrency | Integer | 限制的并发量。 | #### 请求示例 创建靶点优化作业，作业名称为demo-job，受体文件为project:/dir/file，配体文件为project:/dir/file，时间步长为2fs，温度为300k，能量最小化步数为10000，nvt为200ps，npt为500ps，平衡步骤模拟时长为50ns。 ``` https://{endpoint}/v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/drug-jobs/target-optimization { "basic_info" : { "name" : "demo-job", "labels" : [ "labelA" ] }, "receptor" : { "file" : { "source" : "PRIVATE", "url" : "project:/dir/file" }, "balanced_charge" : true, "water_model" : "tip3p", "force_field" : "amber99sb", "ion_type" : "NaCl", "ion_concentration" : 0.15 }, "ligand" : { "file" : { "source" : "PRIVATE", "url" : "project:/dir/file" }, "force_field" : "gaff" }, "md_params" : { "timestep_size" : 2, "temperature" : 300, "step_params" : { "energy_minimization_steps" : 10000, "nvt" : 200, "npt" : 500, "simulation_time" : 50 } } } ``` #### 响应示例 **状态码： 201** CREATED - 创建靶点优化作业成功。 ``` { "id" : "baabcb56-5bb6-11eb-8a0d-fa163e3ddba1" } ``` - 创建靶点优化作业成功，当前运行作业数已达配额限制，此作业会等待。 ``` { "id" : "baabcb56-5bb6-11eb-8a0d-fa163e3ddba1", "limit_concurrency" : 50 } ``` #### 状态码 | 状态码 | 描述 | |:---|:---| | 201 | CREATED | #### 错误码 请参见[错误码](https://support.huaweicloud.com/api-eihealth/ErrorCode.html)。