# 创建分子生成作业 #### 功能介绍 创建分子生成作业。 #### URI POST /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/drug-jobs/generation 表1路径参数 | 参数 | 是否必选 | 参数类型 | 描述 | |:---|:---|:---|:---| | project_id | 是 | String | 项目ID，您可以从获取项目ID中获取。 最小长度：**1** 最大长度：**128** | | eihealth_project_id | 是 | String | 平台项目ID。 最小长度：**1** 最大长度：**128** | #### 请求参数 表2请求Header参数 | 参数 | 是否必选 | 参数类型 | 描述 | |:---|:---|:---|:---| | X-Auth-Token | 是 | String | 用户Token。Token认证就是在调用API的时候将Token加到请求消息头，从而通过身份认证，获得操作API的权限，获取Token接口响应消息头中X-Subject-Token的值即为Token。 最小长度：**1** 最大长度：**32768** | 表3请求Body参数 | 参数 | 是否必选 | 参数类型 | 描述 | |:---|:---|:---|:---| | basic_info | 是 | [CreateDrugJobBasicInfo] object | 作业基本信息。 | | smiles_list | 否 | Array of strings | 分子表达式列表。 最小长度：**1** 最大长度：**512** 数组长度：**10 - 10000** | | molecule_file | 否 | [DrugFile] object | 分子文件，分子表达式列表和分子文件二选一，分子文件优先级最高。 | | binding_sites | 否 | Array of [BindSiteDto] objects | 靶点列表。 数组长度：**0 - 2** | | weak_constraints | 否 | Array of [WeakConstraintDto] objects | 弱约束集合。 数组长度：**0 - 10** | | strong_constraints | 否 | Array of [StrongConstraintDto] objects | 强约束集合。 数组长度：**0 - 5** | | base_model_id | 否 | String | 基模型id。 缺省值：**pangu-drug-model** 最小长度：**0** 最大长度：**128** | | model_ids | 否 | Array of strings | 模型id列表。 最小长度：**1** 最大长度：**128** 数组长度：**0 - 10** | | num_trials | 否 | Integer | 生成分子数量。 最小值：**0** 最大值：**5000** 缺省值：**5000** | 表4CreateDrugJobBasicInfo | 参数 | 是否必选 | 参数类型 | 描述 | |:---|:---|:---|:---| | name | 是 | String | 作业的名称，取值范围：\[5,64\]，允许大小写字母、数字、空格、下划线(_)和中划线(-),只能以数字或字母开头。 最小长度：**5** 最大长度：**64** | | labels | 否 | Array of strings | 标签，取值范围\[0,5\]，单个标签最大长度32字符，支持中文、字母、数字、空格、下划线和中划线，且不能以空格开头或者结尾。 最小长度：**1** 最大长度：**32** 数组长度：**0 - 5** | | upstream_job_info | 否 | String | 上游作业信息。 最小长度：**1** 最大长度：**10240** | 表5DrugFile | 参数 | 是否必选 | 参数类型 | 描述 | |:---|:---|:---|:---| | source | 是 | String | 受体的数据源：外部网络数据（如RCSB在线数据库）、用户私有数据中心、承载租户公共数据（含样例/公共库）。 枚举值： - **EXTRANET** - **PRIVATE** - **PUBLIC** - **RAW** | | url | 否 | String | 文件URL，当数据源为外部网络数据时为https地址；用户私有数据中心为项目路径、公共数据场景为obs地址。 最小长度：**1** 最大长度：**2000** | | format | 否 | String | 文件格式，支持PDB、SDF、MOL2、SMI，仅数据源为RAW时提供。 最小长度：**1** 最大长度：**6** | | data | 否 | String | 文件原始数据，仅数据源为RAW时提供。 最小长度：**0** 最大长度：**10000000** | 表6BindSiteDto | 参数 | 是否必选 | 参数类型 | 描述 | |:---|:---|:---|:---| | name | 否 | String | 靶点名称，只能设置为target1或者target2。 最小长度：**1** 最大长度：**128** | | receptor | 是 | [ReceptorDrugFile] object | 受体文件。 | | engine | 否 | String | 对接引擎，支持DSDP、AUTODOCK_VINA。 缺省值：**AUTODOCK_VINA** 最小长度：**0** 最大长度：**15** | | docking_type | 否 | String | 对接类型，支持BLIND_DOCKING、POCKET_DOCKING。 缺省值：**POCKET_DOCKING** 最小长度：**0** 最大长度：**15** | | bounding_box | 否 | [BoundingBoxDto] object | 结合口袋，包含口袋中心位置和尺寸大小。 | | remove_ion | 否 | Boolean | 去除受体中的离子。 缺省值：**true** | | remove_water | 否 | Boolean | 去除受体中的水分子。 缺省值：**true** | | remove_ligand | 否 | Boolean | 去除受体中的配体分子。 缺省值：**true** | | add_hydrogen | 否 | Boolean | 增加氢原子。 缺省值：**false** | 表7ReceptorDrugFile | 参数 | 是否必选 | 参数类型 | 描述 | |:---|:---|:---|:---| | source | 是 | String | 受体的数据源：外部网络数据（如RCSB在线数据库）、用户私有数据中心、承载租户公共数据（含样例/公共库）。 枚举值： - **EXTRANET** - **PRIVATE** - **PUBLIC** - **RAW** | | url | 否 | String | 文件URL，当数据源为外部网络数据时为https地址；用户私有数据中心为项目路径、公共数据场景为obs地址。 最小长度：**1** 最大长度：**2000** | | format | 否 | String | 文件格式，仅支持PDB，仅数据源为RAW时提供。 最小长度：**1** 最大长度：**6** | | data | 否 | String | 文件原始数据，仅数据源为RAW时提供。 最小长度：**0** 最大长度：**10000000** | 表8BoundingBoxDto | 参数 | 是否必选 | 参数类型 | 描述 | |:---|:---|:---|:---| | center | 是 | Array of doubles | 口袋中心坐标； x, y, z轴的坐标。 最小值：**-9999999** 最大值：**99999999** 数组长度：**3 - 3** | | size | 是 | Array of floats | 口袋尺寸大小； x, y, z轴的大小。 最小值：**2** 最大值：**500** 数组长度：**3 - 3** | | padding | 否 | Float | 填充。 最小值：**0** 最大值：**20** | 表9WeakConstraintDto | 参数 | 是否必选 | 参数类型 | 描述 | |:---|:---|:---|:---| | id | 否 | String | 自定义模型id，仅弱约束为模型时填写。 最小长度：**1** 最大长度：**128** | | name | 否 | String | 属性名称。 最小长度：**1** 最大长度：**128** | | type | 是 | String | 属性约束类型。 枚举值： - **bool** - **range** - **struct** - **minimize** - **maximize** - **interaction** | | bool | 否 | Boolean | 属性约束类型bool的参数。 | | range | 否 | Array of floats | 属性约束类型range的参数。 最小值：**-9999** 最大值：**9999** 数组长度：**2 - 2** | | struct | 否 | [StructureConstraintParamsDto] object | 结构约束参数。 | | quantiles | 否 | Array of floats | 属性约束类型minimize和maximize的参数。 最小值：**0.0** 最大值：**1.0** 数组长度：**2 - 2** | | interaction | 否 | [InteractionConstraintDto] object | 相互作用力约束参数。 | 表10StrongConstraintDto | 参数 | 是否必选 | 参数类型 | 描述 | |:---|:---|:---|:---| | id | 否 | String | 自定义模型id，仅强约束为模型时填写。 最小长度：**1** 最大长度：**128** | | name | 否 | String | 属性名称。 最小长度：**1** 最大长度：**128** | | type | 是 | String | 属性约束类型。 枚举值： - **bool** - **range** - **struct** - **interaction** | | bool | 否 | Boolean | 属性约束类型bool的参数。 | | range | 否 | Array of floats | 属性约束类型range的参数。 最小值：**-9999** 最大值：**9999** 数组长度：**2 - 2** | | struct | 否 | [StructureConstraintParamsDto] object | 结构约束参数。 | | interaction | 否 | [InteractionConstraintDto] object | 相互作用力约束参数。 | 表11StructureConstraintParamsDto | 参数 | 是否必选 | 参数类型 | 描述 | |:---|:---|:---|:---| | structs | 是 | Array of strings | 子结构SMILES。 最小长度：**1** 最大长度：**120** 数组长度：**1 - 8** | | exclusive | 是 | Boolean | 是否排除子结构。 | | operator | 否 | String | 多个子结构之间的逻辑关系。 枚举值： - **or** - **and** | 表12InteractionConstraintDto | 参数 | 是否必选 | 参数类型 | 描述 | |:---|:---|:---|:---| | interactions | 是 | Array of [Interaction] objects | 相互作用力列表。 数组长度：**1 - 8** | | exclusive | 是 | Boolean | 是否排除指定的约束作用力。 | | operator | 否 | String | 多个作用力之间的逻辑关系。 枚举值： - **or** - **and** | 表13Interaction | 参数 | 是否必选 | 参数类型 | 描述 | |:---|:---|:---|:---| | binding_site | 是 | String | 靶点，只支持target1或target2。 最小长度：**1** 最大长度：**128** | | type | 是 | String | 相互作用力类型：氢键、疏水作用、盐桥、π-π堆积、π-阳离子。 枚举值： - **hydrogen_bond** - **hydrophobic_action** - **salt_bridge** - **pi_stacking** - **pi_cation** | | amino_acid | 是 | String | 氨基酸。 最小长度：**4** 最大长度：**16** | #### 响应参数 **状态码： 201** 表14响应Body参数 | 参数 | 参数类型 | 描述 | |:---|:---|:---| | id | String | 作业id。 | | limit_concurrency | Integer | 限制的并发量。 | #### 请求示例 创建分子生成作业，输入方式为分子表达式，作业名称为demo-job，分子文件为project:/dir/file，靶点设置的受体文件为project:/test.pdb，口袋中心位置为\[0,0,0\]，口袋尺寸大小为\[500,500,500\]，设置弱约束为eye_corrosion，类型为布尔值，值为true，设置强约束为sascore，类型为range，值为\[0,1\]。 ``` https://{endpoint}/v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/drug-jobs/generation { "basic_info" : { "name" : "demo-job", "labels" : [ "labelA" ] }, "molecule_file" : { "source" : "PRIVATE", "url" : "project:/dir/file" }, "num_trials" : 500, "binding_sites" : [ { "name" : "target1", "receptor" : { "source" : "PRIVATE", "url" : "project:/test.pdb" }, "engine" : "DSDP", "bounding_box" : { "center" : [ 0, 0, 0 ], "size" : [ 500, 500, 500 ] }, "remove_ion" : false, "remove_water" : false, "remove_ligand" : false } ], "weak_constraints" : [ { "name" : "eye_corrosion", "type" : "bool", "bool" : true } ], "strong_constraints" : [ { "name" : "sascore", "type" : "range", "range" : [ 0, 1 ] } ] } ``` #### 响应示例 **状态码： 201** CREATED - 创建分子生成作业成功。 ``` { "id" : "baabcb56-5bb6-11eb-8a0d-fa163e3ddba1" } ``` - 创建分子生成作业成功，当前运行作业数已达配额限制，此作业会等待。 ``` { "id" : "baabcb56-5bb6-11eb-8a0d-fa163e3ddba1", "limit_concurrency" : 50 } ``` #### 状态码 | 状态码 | 描述 | |:---|:---| | 201 | CREATED | #### 错误码 请参见[错误码](https://support.huaweicloud.com/api-eihealth/ErrorCode.html)。