# 单分子预对接 - CreateMolDockingJob #### 功能介绍 单分子预对接。 #### 授权信息 账号具备所有API的调用权限，如果使用账号下的IAM用户调用当前API，该IAM用户需具备调用API所需的权限，具体权限要求请参见[权限和授权项](https://support.huaweicloud.com/api-ai4sservice/ai4sservice_03_0100.html)。 #### URI POST /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/drug-common/mol-docking 表1路径参数 | 参数 | 是否必选 | 参数类型 | 描述 | |:---|:---|:---|:---| | project_id | 是 | String | **参数解释**： 项目ID，您可以从[获取项目ID](https://support.huaweicloud.com/api-ai4sservice/ai4sservice_03_0033.html)中获取。 **约束限制**： 不涉及 **取值范围**： 仅支持字母、数字、中划线和下划线，长度为\[1-128\]个字符。 **默认取值**： 不涉及 | | eihealth_project_id | 是 | String | **参数解释**： 空间ID，您可以从[获取空间ID](https://support.huaweicloud.com/api-ai4sservice/ai4sservice_03_0099.html)中获取。 **约束限制**： 不涉及 **取值范围**： 仅支持字母、数字、中划线和下划线，长度为\[1-128\]个字符。 **默认取值**： 不涉及 | #### 请求参数 表2请求Header参数 | 参数 | 是否必选 | 参数类型 | 描述 | |:---|:---|:---|:---| | X-Auth-Token | 是 | String | **参数解释**： 用户Token。 Token认证就是在调用API的时候将Token加到请求消息头，从而通过身份认证，获得操作API的权限，[获取Token](https://support.huaweicloud.com/api-ai4sservice/ai4sservice_03_0011.html)接口响应消息头中X-Subject-Token的值即为Token。 **约束限制**： 不涉及 **取值范围**： 长度为\[1-32768\]个字符。 **默认取值**： 不涉及 | 表3请求Body参数 | 参数 | 是否必选 | 参数类型 | 描述 | |:---|:---|:---|:---| | receptor | 是 | [ReceptorDto] object | **参数解释**： 受体文件。 **约束限制**： 不涉及 **取值范围**： 不涉及 **默认取值**： 不涉及 | | ligand | 是 | [DrugFile] object | **参数解释**： 配体文件。 **约束限制**： 不涉及 **取值范围**： 不涉及 **默认取值**： 不涉及 | | engine | 否 | String | **参数解释**： 引擎。 **约束限制**： 不涉及 **取值范围**： - DSDP - AUTODOCK_VINA **默认取值**： AUTODOCK_VINA | 表4ReceptorDto | 参数 | 是否必选 | 参数类型 | 描述 | |:---|:---|:---|:---| | name | 否 | String | **参数解释**： 靶点名称，仅支持target1、target2。 **约束限制**： 不涉及 **取值范围**： - target1：靶点名称target1。 - target2：靶点名称target2。 **默认取值**： 不涉及 | | receptor | 是 | [ReceptorDrugFile] object | **参数解释**： 受体文件。 **约束限制**： 不涉及 **取值范围**： 不涉及 **默认取值**： 不涉及 | | bounding_box | 否 | [BoundBoxDto] object | **参数解释**： 结合口袋，包含口袋中心位置和尺寸大小。 **约束限制**： 不涉及 **取值范围**： 不涉及 **默认取值**： 不涉及 | | remove_ion | 否 | Boolean | **参数解释**： 去除受体中的离子。 **约束限制**： 不涉及 **取值范围**： - true：去除受体中的离子。 - false：不去除受体中的离子。 **默认取值**： true | | remove_water | 否 | Boolean | **参数解释**： 去除受体中的水分子。 **约束限制**： 不涉及 **取值范围**： - true：去除受体中水分子。 - false：不去除受体中水分子。 **默认取值**： true | | remove_ligand | 否 | Boolean | **参数解释**： 去除受体中的配体分子。 **约束限制**： 不涉及 **取值范围**： - true：去除受体中配体分子。 - false：不去除受体中配体分子。 **默认取值**： true | | add_hydrogen | 否 | Boolean | **参数解释**： 增加氢原子。 **约束限制**： 不涉及 **取值范围**： - true：增加氢原子。 - false：不增加氢原子。 **默认取值**： false | 表5ReceptorDrugFile | 参数 | 是否必选 | 参数类型 | 描述 | |:---|:---|:---|:---| | source | 是 | String | **参数解释**： 受体数据源。 **约束限制**： 不涉及 **取值范围**： - EXTRANET：外部网络数据 - PRIVATE：私有数据 - PUBLIC：公共数据 - RAW：源数据 **默认取值**： 不涉及 | | url | 否 | String | **参数解释**： 文件URL。 **约束限制**： 当数据源source为外部网络数据时为https地址，为用户私有数据中心时为项目路径，为公共数据场景时为obs地址。 **取值范围**： URL仅支持.pdb结尾，长度为\[1-2000\]个字符 **默认取值**： 不涉及 | | format | 否 | String | **参数解释**： 文件格式，仅支持PDB。 **约束限制**： 仅数据源source为RAW时提供。 **取值范围**： - PDB **默认取值**： 不涉及 | | data | 否 | String | **参数解释**： 文件原始数据。 **约束限制**： 仅数据源source为RAW时提供。 **取值范围**： 长度为\[0-10000000\]个字符。 **默认取值**： 不涉及 | 表6BoundBoxDto | 参数 | 是否必选 | 参数类型 | 描述 | |:---|:---|:---|:---| | center | 是 | Array of doubles | **参数解释**： 口袋中心坐标，x、y、z轴的坐标。 **约束限制**： 坐标数量固定为3，坐标大小取值为\[-9999999-99999999\]。 **取值范围**： 不涉及 **默认取值**： 不涉及 | | size | 是 | Array of floats | **参数解释**： 口袋尺寸大小，x、y、z轴的大小。 **约束限制**： 数组长度固定为3，数组元素取值范围为\[2-500\]。 **取值范围**： 不涉及 **默认取值**： 不涉及 | | padding | 否 | Float | **参数解释**： 填充。 **约束限制**： 不涉及 **取值范围**： 0-20 **默认取值**： 不涉及 | 表7DrugFile | 参数 | 是否必选 | 参数类型 | 描述 | |:---|:---|:---|:---| | source | 是 | String | **参数解释**： 受体数据源。 **约束限制**： 不涉及 **取值范围**： - EXTRANET：外部网络数据 - PRIVATE：私有数据 - PUBLIC：公共数据 - RAW：源数据 **默认取值**： 不涉及 | | url | 否 | String | **参数解释**： 文件URL。 **约束限制**： 当数据源source为外部网络数据时为https地址，为用户私有数据中心时为空间路径，为公共数据场景时为obs地址 **取值范围**： 文件仅URL仅支持以.pdb、.mol2、.sdf、.smi为结尾，长度为\[1-2000\]个字符。 **默认取值**： 不涉及 | | format | 否 | String | **参数解释**： 文件格式。 **约束限制**： 当数据源source为RAW时提供。 **取值范围**： - PDB：PDB文件 - SDF：SDF文件 - MOL2：MOL2文件 - SMI：SMI文件 **默认取值**： 不涉及 | | data | 否 | String | **参数解释**： 文件原始数据。 **约束限制**： 当数据源source为RAW时提供。 **取值范围**： 长度为\[0-10000000\]个字符。 **默认取值**： 不涉及 | #### 响应参数 **状态码：200** 表8响应Body参数 | 参数 | 参数类型 | 描述 | |:---|:---|:---| | vina_score | Float | 对接打分结果。 **参数解释**： 对接打分结果。 **约束限制**： 不涉及 **取值范围**： 不涉及 **默认取值**： 不涉及 | | pose | String | **参数解释**： 对接构象。 **约束限制**： 不涉及 **取值范围**： 不涉及 **默认取值**： 不涉及 | #### 请求示例 单分子预对接，受体文件为project:/dir/file，配体文件为project:/dir/file。 ``` https://{endpoint}/v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/drug-common/mol-docking { "receptor" : { "receptor" : { "source" : "PRIVATE", "url" : "project:/dir/file" }, "bounding_box" : { "center" : [ 0, 0, 0 ], "size" : [ 10, 10, 10 ] }, "remove_water" : true, "remove_ion" : false, "remove_ligand" : false, "add_hydrogen" : true }, "ligand" : { "source" : "PRIVATE", "url" : "project:/dir/file" } } ``` #### 响应示例 **状态码：200** 单分子预对接成功。 ``` { "vina_score" : -5.05 } ``` #### 状态码 | 状态码 | 描述 | |:---|:---| | 200 | 单分子预对接成功。 | #### 错误码 请参见[错误码](https://support.huaweicloud.com/api-ai4sservice/ErrorCode.html)。